子宫内膜异位症的治疗要根据患者的年龄、病情的严重程度、是否有生育需求来决定，具体的治疗方法有：
1、保守治疗：可以采用假孕术或假绝经治疗，在子宫中用药来控制女性的经期，从而达到假孕或者绝经的目的。
2、外科：现在采用的是微创技术，即腹腔镜，对病变进行全面的综合、根治性和半根治性的治疗，提高患者生存期、生活质量、怀孕率。
通常情况下，患者可以通过使用药物、手术治疗等方式进行治疗子宫内膜异位症。具体情况分析如下：
使用药物：子宫内膜异位症患者可以口服避孕药、促性腺激素释放激素激动剂（GnRH-a）、雄激素类药物（丹那唑）、孕激素受体拮抗剂（米非司酮）等。
手术治疗：年轻且有生育要求的患者，应进行保留生育功能手术；已有子女且患者年龄较大，应进行保留卵巢功能手术。
子宫内膜异位症在体内雌激素水平降得非常低，以至于接近没有的时候，它可能会自愈。更年期以后或到绝经期以后，当雌激素降低至原来的五分之一以下，就有自愈的机会，因为那个时候就绝经了，卵巢功能衰退，如果不是这种情况，一般没有自愈的可能。
通常情况下，怀孕不建议治疗子宫内膜异位症。
子宫内膜异位症简称内异症，是子宫内膜组织长在子宫腔和子宫肌层外面位置的一种疾病。患者通常有痛经、血尿、腰痛等不适症状，治疗内异症的目标是去除病灶、减轻疼痛、促进生长发育，而怀孕以后，患者体内雌激素水平会降低，导致异位子宫内膜没有充分的雌激素刺激，就引起异位子宫内膜萎缩甚至死亡，对于异位子宫内膜起到抑制的作用。但并不能去除病灶，减轻疼痛，因此怀孕一般不建议治疗子宫内膜异位症。
当患有子宫内膜异位症时，应积极就医，根据病因治疗。
治疗时要审因论治，针对瘀血这一实质，以活血祛瘀为主，再根据寒热虚实分别施以疏肝理气，温经散寒，益气补肾，清热消症等法。本病在临床以口服汤药效果较好，为提高临床疗效可同时配合针灸、灌肠、外敷药膏等，可以缩短疗程，加速疾病痊愈。
一般情况下，子宫内膜异位的处理方式如下：
1、妊娠分娩是最好的治疗手段，在怀孕和哺乳期间可以起到压制作用，防止内异症，压制病灶，使病灶萎缩、吸收；
2、如果患者无痛经、短期内无生育要求、盆腔B超无包块等症状，可以进行常规的随访，一般是半年或一年一次的妇科或B超；
3、对于疼痛明显、B超包块大、有生育需求但又不能怀孕的患者，应采取外科、探查、术后用药等措施。
