针对症状轻微的肛门脓肿可通过抗生素类药物的应用，缓解症状。症状严重的需进行手术治疗达到的目的。另外，肛门脓肿，患病期间饮食以清淡营养易消化的软食流食为主，根据个人喜好可适当的进食菠菜、芹菜、冬瓜、丝瓜、南瓜、绿豆等食品。
婴儿肛周脓肿长在不同的地方除做好局部的清洁卫生外，应及时到正规医院就诊，给予规范、正确的综合治疗，避免出现肛瘘、肛门狭窄等不良后果。婴儿抵抗力差，患肛周脓肿后病情变化快，易引起败血症，表现为高热或体温不升、表情淡漠或哭闹不安、吃奶少，可发现局部红、肿、热、痛。重者亦可危及生命。
肛周脓肿的危害是可能会形成肛瘘，那么就会引起肛瘘发炎，病人除了会出现肛门剧烈疼痛的情况，破溃后还会出现流脓，并且脓水会污染到内裤，浓汁刺激到局部的皮肤，肛门瘙痒变得更为剧烈。
肛周脓肿早期可用温水坐浴和抗生素控制感染。如有脓液形成，应尽快在正规医院切开引流。多吃清淡的食物，多吃蔬菜和水果，多喝水，避免油腻、辛辣和刺激性食物，注意休息，避免吸烟和酒精刺激，不要挤压肿块。
出现肛旁脓肿的原因特别多：肛窦开口往上，粪便容易侵犯肛窦而导致肛腺感染，肛腺感染以后会沿着直肠向上蔓延，沿着肛管向肛周皮肤蔓延而形成肛旁脓肿，肛门脓肿主要就是因为排大便不畅或者腹压增加时导致。如果人的体质下降，抵抗力比较弱，也容易导致肛腺感染而形成肛旁脓肿。
肛周脓肿主要是由于感染性因素、医源性因素、手术后因素以及其它因素引起的。如果肛周脓肿想要治好，那么是需要采取手术治疗的方式。对于手术治疗是需要采取抽脓减压、挂线术等压引流术等多种手术的方式进行治疗的。如果身体素质较差或者是病情不允许采取手术治疗，也可以采取药物的方式进行保守治疗。
