肛周脓肿属于感染化脓性疾病，但在感染初期，脓肿尚未形成时，可以采取保守治疗，少数肛周脓肿用抗生素，热水坐浴及局部理疗等可以消散。但是也要做好手术的准备，毕竟大部分肛周脓肿采用药物治疗是徒劳的。
骨盆直肠窝脓肿全身症状重，先寒战高热，周身倦怠，严重可有败血症的中毒症状。局部症状轻，仅有直肠下坠感，酸痛或不适的表现，亦可发生排尿困难。直肠后脓肿全身症状与骨盆直肠窝脓肿相似，但局部症状主要在尾骶腰部酸胀坠痛，向背部及两侧大腿放射，尾骨有压痛，不能端坐。直肠粘膜下脓肿有周身不适，倦怠，发热。
骨盆直肠窝脓肿全身症状重，先寒战高热，周身倦怠，严重可有败血症的中毒症状。局部症状轻，仅有直肠下坠感，酸痛或不适的表现，亦可发生排尿困难。直肠后脓肿全身症状与骨盆直肠窝脓肿相似，但局部症状主要在尾骶腰部酸胀坠痛，向背部及两侧大腿放射，尾骨有压痛，不能端坐。直肠粘膜下脓肿有周身不适，倦怠，发热。
术后需要恢复大约一个月时间。及时行切开引流术，因为脓肿切开引流是治疗肛周脓肿的主要方法，术后要给予病人止痛、换药等处理，并且要积极保持好病人的引流通畅，这样比病人才能恢复良好。
肛周脓肿症状初期是：起初发现肛门直肠周围有一个小硬块或肿块。继而局部突然出现剧烈疼痛难以忍受、红肿发热、坠胀不适、坐卧不宁、里急后重、大便秘结、排尿不畅，有直肠刺激症状，并随之出现如体温升高、食欲不振、寒战、神疲乏力等全身中毒症状。一般1周左右即可形成脓肿。脓肿形成后在肛门周围或直肠指诊可以触到波动、柔软的脓腔。此时用注射器穿刺可抽出脓液。
