疼痛期主要表现为牙痛，咽痛和口腔溃疡。
水泡期口腔黏膜的任何区域均可出现簇状小水泡，仿佛针头那么大，尤其在乳磨牙龈缘附近更甚，泡壁通透，粉碎后形成浅表溃疡。溃破后有少量脓性分泌物流出，疼痛难忍。糜烂期时水泡少，而汇集成簇、溃破后则可造成大范围糜烂。恢复期，在口腔溃疡和粘膜充血水肿消退后，复盖一层淡红色或白色假膜。愈合期全程需7~10天，糜烂面渐渐萎缩痊愈。
如果是单纯的疱疹性口腔炎，需要及时进行有效的处理，一星期后即可完全康复。
采用一种抗病毒疗法，疱疹性龈口炎是由于单纯疱疹病毒所致的口腔病变，粘膜会产生大量的充血水肿，形成大量的小水泡。如果是破溃的患者，出现了细菌感染，会导致伤口的恢复速度延长，所以要养成良好的生活习惯和饮食习惯，避免食用一些易引起上火的食物。
要经常保持新生儿的口腔卫生，多饮水、禁用刺激性药物，预防口腔炎症，不要让小孩吃一些辣的东西在口腔疱疹期间，要停服牛奶、少吃高蛋白一类的食物，多吃青菜、水果等清热的食物，严格执行消毒隔离制度。
疱疹性口腔炎期间最好是不要吃鸡蛋，主要是由于病毒感染导致的疱疹性口腔炎的情况，平时应该注意清淡饮食，避免吃油腻的东西，一般这种由于病毒感染导致的疱疹性口腔炎，至少需要一周到两周的时间才能够完全的恢复好。
疱疹性口腔炎多见于婴儿或儿童，患儿有躁动不安，发热，头痛，咽痛，啼哭拒食等症状，2～3日后体温逐渐下降，可在口腔粘膜任何部位出现病损，如唇，颊，舌以及角化良好的硬腭，牙龈和舌背，初起粘膜充血，发红，水肿，并出现数目较多成簇的。
疱疹性口腔炎的症状主要有以下几种，口腔内会突然有疱疹，大小不等，也很有可能是溃疡面，呈满天星样，但是疱疹并不累及牙龈，患者很有可能会剧烈疼痛，同时伴有发热的情况。