治疗性功能障碍的办法有中医疗法、物理疗法、食疗法等，其中物理疗法有一种是电子通络治疗法。运用尖端性功能障碍综合康复仪，集现代计算机技术、自动控制技术、电脉冲技术、数字显示技术、磁场辐射技术为一体，具备电脉冲激、负压吸引、气动按摩等多项物理治疗方式，通过专用器具施治于人体阴茎及有关穴位，调节大脑皮质功能，兴奋脊髓性中枢活动，扩张阴茎动静脉血管，激活海绵体动力、增粗阴茎海绵体的体积等整体治疗效果。
抑郁症是一组神经症会出现植物神经功能紊乱，影响到内分泌，会出现阳痿的情况。治疗应采取综合治疗为主，每天练一下太极拳和做一下瑜伽，另外多和亲朋好友沟通，多参加一些聚会，出去旅游，宣泄自己内心的情绪，释放出来。必要时在抗抑郁治疗的基础上，能适当服用一点药物等，随时复诊，调整治疗方案。
常见的男性性功能障碍有勃起障碍、射精障碍、性指向异常等，常见的是前两种，尤其是勃起功能障碍。男性出现勃起功能障碍，应先询问近6月内有无做过系统的内科查体，因为勃起是全身状态的反映，高血压、糖尿病、高脂血症、器官功能异常等内科疾病都可以造成勃起障碍。然后到泌尿科或男科做系统检查，尽量明确病因，然后做相应的治疗或行为调整。治疗男性勃起障碍的药物、器械、手术都进展很快，可以根据病情决定治疗方式。
首先不明确原因的情况，一定要到正规的医院去做个身体的系统检查。比如有血常规、勃起功能，内分秘功能、以及肾脏功能等做个系统的检查，排除病变可能性，有些问题可能并不太严重，只需要稍微调理即可，但前提是要做检查，否则不能下定义。
性功能障碍是一大类的疾病，在临床上性功能障碍比较高发的是阳痿和早泄。对于阳痿早泄的治疗，目前可以通过性感集中疗法进行治疗。主流的治疗方法还是通过口服药物来治疗，口服药物同时也要接受心理治疗。
心理性功能障碍可以通过心理治疗、药物治疗等方式进行治疗。
对于心理性功能障碍，处理仍以心理处理为主，由于这种心理性功能障碍，常无器质性之病灶，对心理性性功能障碍实施心理性治疗是行之有效的说法，通常都能达到较理想的结果。对于这类疾病，如果患者自身患有其他方面的问题的话，也可能会造成心理性功能障碍因素。以心理性性功能障碍为目标，常常还要有性心理专家和患者交流，了解患者发生性功能障碍的主要因素是什么，进而有针对性地加以处理。如果病人出现了性功能问题，就会影响到正常生活，而且还会对患者本身产生一定的负面影响，所以要及时进行心理咨询。对于这类患者，一边心理治疗，也可协助某些药物治疗，同时对于此类患者，也常需其性伴侣，同时以患者为治疗对象，对患者给予激励，使患者信心百倍，进而使患者的性功能逐步恢复正常。
