小儿慢性肠炎的发病率很高，一般是因为病毒感染而导致的，一般情况下，小儿慢性肠炎的治疗主要根据病毒和非侵入性细菌来判断。
临床表现出明显的中毒症状，尤其是新生儿、婴幼儿、重症患儿可选用抗生素。抗生素不能治疗由病毒引起的肠炎。治疗由寄生虫引起的肠炎需要服用一些抗寄生虫的药物。可以适当选择胃肠粘膜保护剂和微生态治疗。
宝宝慢性肠炎可以口服补液盐药物进行治疗。同时，多饮水，定时定量哺乳，暂时不要添加新的辅食。观察病情，主要看看有无脱水的表现。比如尿量减少，哭时无泪等。如果症状比较剧烈，治疗方法没有明显好转，就要及时到医院就诊。
用于长期反复拉肚子不好，超过一个月左右就是慢性肠炎。多见的就是伪膜性肠炎或者是过敏性肠炎。就是由于长期使用抗药物引起的。同时注意一下过敏原因导致的过敏性胃肠炎，关键是要找到过敏原，避免在次接触。
慢性肠炎是有由细菌、病毒或者寄生虫引起的胃肠道疾病。治疗慢性肠炎时需根据细菌药物敏感实验结果选用合适的抗菌药物。还有就是需要补充足够的液体以及纠正电解质和酸中毒。建议在日常生活中要有良好的用餐习惯，不吃变质和不干净的食物。养成餐前便后洗手的习惯。
小孩慢性肠炎是临床常见的症状之一，很多都有腹胀，大便次数增多等症状。治疗上可以口服药物改善腹泻、腹痛症状，也可以口服中药来进行治疗。同时注意饮食，不要饮酒和进食辛辣刺激的、生冷的食物。
应采取中医治疗，按中医分型辨证施治用汤药治疗，同时可加用针刺治疗以调整肠道功能紊乱。抗生素治疗，早期用适当的可吸收的抗菌药物治疗，可明显减轻症状和减少菌的排出。
