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与心室流出道是否合并梗阻、治疗是否及时有关。病情轻且积极治疗的患者，若心室流出道轻度梗阻，对心室舒张功能、冠脉供血无显著影响，这类患者症状轻微，心脏功能基本不受影响，预期寿命甚至与普通人无异。
肥厚性心肌病需根据具体病症进行治疗。
肥厚型心肌病一时之梗阻性肥厚型心肌疾病，针对该病的治疗，可以选择药物保守治疗，常用的药物有纠正心衰的药物、逆转心室重构的药物，例如β受体阻滞剂等。梗阻型肥厚性心肌疾病比较危险。因为梗阻往往会出现低血压、恶性心律失常、心绞痛等症状。如果心排血量受阻，会导致机体供血不足，脑供血不足，冠状动脉供血不足，这是非常危险的。一般都会选择无水酒精消融，这样可以减轻梗阻，从根本上治疗。
肥厚性疾病的处理相对困难，以不一定能根治为主。
肥厚性心肌病以改善症状为主，降低并发症，防止猝死的发生，其中，药物治疗为肥厚性心脏病治疗提供了依据，以流出道梗阻为治疗目标的药物包括β受体拮抗剂，非二氢吡啶类钙通道阻滞剂等。当存在心衰时需针对心衰进行药物治疗，在伴有房颤的情况下，需给予抗凝治疗。对胸闷不舒服患者，应用硝酸酯类时，应引起重视，要排除外流道梗阻，以免用了以后加重病人的病症。非药物治疗以手术为主，酒精室间隔消融术为辅，及起搏治疗，对现在的病人普遍建议酒精室间隔消融，但还需结合适应症而定。
肥厚性心肌病患者可以选择药物或是手术治疗。
症状轻微的患者可以选择药物治疗来改善病情的症状，常见的药物有β阻滞剂，能够改善心肌供血，加上使用活血化瘀的中药，促进血液循环。严重的患者可能要采取手术治疗。肥厚性心肌病患者，一般通过心脏B超检查可以发现病情，主要是查看室间隔与左室后壁的比例，正常情况下是1公分，如果超过1.2公分，那么可能就会出现流血道的堵塞，引起晕厥、心脏骤停的情况。
此外，患者在日常生活中，要养成良好的生活饮食习惯，避免情绪波动。
一般情况下，肥厚性心肌病能手术，具体内容如下：
如果患者患有肥厚性心肌病，但使用药物治疗该症的作用并不明显，或患者已经出现了比较严重的流出道梗阻，患者可以遵医嘱接受室间隔切除术来进行治疗，从而控制病情发展，缓解患者的不适症状。在进行手术前，患者应完善各项检查，以排除各项手术禁忌症，以免身体无法耐受手术。
肥厚心肌病患者可以通过消融手术进行治疗，还可以选择药物治疗控制疾病进展，肥厚性心肌病病人可选用扩张血管药品，还可使用降压药品或利尿药品缓解，单纯靠中药疗效不甚理想。
平时多加注意身体护理，定期去医院通过心电图检测进行判断。肥厚型心肌病病人选用β受体阻滞剂，可有效避免心脏部位收缩减弱，对肥厚性心肌病疗效均有效。
对于已经确诊为肥厚性心肌病者，需要积极地配合中医和西医治疗，同时在日常饮食方面注意清淡，避免肥甘厚味。肥厚性心肌病病人应定期体检，可选用药物治疗，控制疾病进展，可选用中药，改善血液循环，还可选用中西医结合的方法。
