可在病变的龟头，包皮上取材镜检或培养可找到念珠菌，滴虫性龟头炎可在分泌物上找到滴虫。或是直接镜检这种龟头炎的检查是刮取阴茎龟头、冠状沟或包皮处皮损表面鳞屑作为待检标本。
滴虫性尿道炎是男性比较常见的，可以观察一下尿道有没有烧灼痛而尿道口处痒感，或者伴有尿频、尿急、尿痛的现象，也可以取新鲜的尿道分泌物做镜检可发现活动的毛滴虫，也可以做一下膀胱尿道镜检查。
通常情况下，肠毛滴虫病患者要做粪便培养、免疫学方法等检查，具体情况分析如下：
粪便培养：毛滴虫是寄生于肠道的鞭毛虫，多见于盲肠与结肠，可引起腹泻等临床症状，肠毛滴虫病患者可以做粪便培养，检查粪便中是否有虫卵。
免疫学方法：肠毛滴虫病患者可以做免疫学方法，常用的免疫学方法有荧光抗体检查法、ELISA法、胶乳凝集法等，可以检测肠毛滴虫的特异性抗原以寻找毛滴虫。
滴虫感染时影响阴道细胞，应注意与恶性肿瘤鉴别，必要时可于治疗后作阴道细胞学检查。取阴道分泌液用悬滴法检查，在镜下可找到活动的滴虫，在染色涂片中亦可见到。必要时可进行培养。
通常，女性妊娠合并滴虫阴道炎要做以下几项检查：
1、常规妇科检查：女性可以做妇科检查及阴道镜，可以看见阴道粘膜出现鲜红色片状，或者是散在红点状皮损，后穹隆有黄绿色分泌物，呈稀薄状、脓性泡沫状。
2、病原学检查：通常取阴道分泌物，并滴在有生理盐水的玻片上，从显微镜下观察波状运动的滴虫，还有增多的白细胞。
3、分泌物培养：如果女性阴道瘙痒，以及有黄绿色、臭味分泌物，但悬滴法检查病原学检查多次均为阴性，可以做分泌物培养。
白带发黄有异味，大多与炎症有关，一般通过白带常规的检查，可以检测有没有滴虫性阴道炎。执行白带常规检测即可明确是否存在滴虫感染的。体检也是可以检查出来的。多注意私处的卫生清洁，防止感染炎症。
