口腔溃疡的治疗以消除病因、增强体质、对症治疗为主，治疗方法应坚持全身治疗和局部治疗相结合，中西医治疗相结合，生理和心理治疗相结合。口腔溃疡常呈周期性发作，复发时间长短与口腔溃疡病史长短有密切关系。
药物治疗：配合中西类止疼消炎的药物来进行治疗。免疫力治疗：由于该病原因复杂，如果由免疫力降低引起，想缓解病情还得提高自身免疫力，必要多补充维生素，来补充流失掉的微量元素。
口腔溃疡多般是由于上火、炎症、感染和免疫力低下以及缺乏维生素等原因造成的。对于其初期的治疗可以用口含片或者是喷剂进行治疗，另外要注意口腔卫生和饮食清淡，此外还可以适当补充b族维生素并多喝水。
口腔溃疡可以在医生的指导下服用抗炎药物可有效抑制细菌滋生。口腔溃疡是因为人体口腔表面细菌分布过多，导致舌体、口腔内部发生炎症反应引发口腔溃疡，可以多吃一些流食或者半流食，例如面条、面片、蔬菜粥。不过要注意吃的食物温度不能太高，以免烫伤口腔黏膜，加重溃疡的病情。
口腔溃疡属于一种病因不明的疾病，临床口腔溃疡由于病因不明，治疗的方案就是对症治疗。口腔溃疡临床治疗没有什么特效的疗效，一般七天左右可以自愈。补充维生素对口腔溃疡愈合有很大的帮助。
如果特别疼痛，可以局部外用一些止痛的药物。还有一种较重的口腔溃疡叫做腺周口疮，是一种较大而深的口腔溃疡，愈后可能会留有瘢痕，相对而言，这种口腔溃疡也有一定的自限性，大概在1个月左右就会有明显的好转。临床上需要注意的是1个月以上，而病变范围逐渐增大的溃疡，可能会有癌变的风险，必要时可以做局部活检来明确诊断。
