一般情况下，引起慢性直肠炎的病因有很多，应在辩证的基础上，明确病因，根据病因，对症治疗。
口服药物有时候是中成药，有时候是中草药熬制成汤剂，中成药用的比较多的是肠炎宁，归脾丸，补充益气丸等。中草药一般是具有清热解毒，消肿散结，消炎止疼的功效，临床上比如黄连，黄芪，党参，蒲公英，五倍子等。也可以用以上中药煎汤灌肠治疗。取足三里、上巨虚、天枢穴、合谷穴等穴位。
慢性直肠炎保守治疗较好，通常是用药以及灌肠，因为这种病易复发，所以在日常需要注意补充蛋白质以及维生素，吃一些易消化的食物，慢性直肠炎多是与个人体质、饮食习惯、作息规律等因素有关。所以在平时调整一下不良因素。
慢性直肠炎不治疗，很少能自己好转。慢性直肠炎以血便，排便不畅，腹痛为主要症状，可以使用抗生素及调节肠道功能的药物，平时给予低脂，易消化，少渣易消化饮食。做到心情愉快，营养丰富，劳逸结合。
慢性直肠炎的治疗首先要保持正常的生活习惯和饮食习惯，平时少吃辛辣刺激的食物，尽量避免疲劳和熬夜，尽量避免长时间坐着、蹲着和站着，此外，可以用复方黄柏叶保留灌肠，注意保持心情舒畅。
慢性直肠炎可以用中医治好的。但是这是慢性疾病，治疗比较缓慢，只能慢慢缓解。这种疾病饮食上要注意，不要吃辛辣、油炸的食物，以粗纤维食物为主，这样对病情的恢复，还是有帮助的。可以口服相关药物进行治疗。
