窦性心律不齐的原因包括生理性原因和病理性原因，具体分析如下：
窦性心律不齐是指心率会随着呼吸而改变，是心律失常的一种类型可能与功能性心律不齐等生理原因，服用洋地黄、吗啡或部分颅内高压等病理性原因有关，可以通过心电图明确诊断。大多数情况下，窦性心律不齐不用采取手段进行治疗，保持定期复查即可。
日常生活中，患者应注意多休息，避免过度劳累，保持心态平和。
窦性心律不齐是一种正常的生理现象，是指窦房结发出的激动不规则，心动周期显著快慢不均，引起窦性心律不齐的原因与植物神经不稳定，导致功能失调或紊乱有关，青春期后会自行消失。
窦性心律是一种正常节律。
窦性心率异常时表现为心动过缓、心动过速及心室颤动三种类型。窦性心律来源不变，但是节律不整的情况下，相同导联的P-P间期的差值>0.12s称为窦性心律不齐，多伴有窦性心动过缓。当窦房结电活动发生改变时也可能出现类似的异常变化。从规律性窦性心律来看，有时由于迷走神经的张力增高或窦房结障碍，窦房结有一定时间不再发放兴奋，称为窦性停搏。起搏传导系统的退行性病变和冠心病、心肌炎（尤其是病毒性心肌炎）、心肌病及其他疾患，可影响窦房结及周围组织，出现一系列缓慢窦性心律失常，并且造成头昏，黑蒙、晕厥及其他临床表现，称病态窦房结综合征。
正常人心率均由窦房结分发，称为窦性心律，为正常心率，若非窦性心律，则可视为不正常心率，窦性心律不齐提示其为起源点，不齐是由以下几方面因素造成，一是生理性，例如，青年儿童，青春期时期的少年儿童，可随呼吸而变化，引起一种窦性心律不齐，但成年后，如窦性心律不齐，这也许是因为某些疾病引起，例如，窦房结的功能出现了异常，或其他疾病引起窦性心律不齐，患者可能会出现心悸、胸闷、头晕、疲劳乏力等症状。
在医学上，窦性心律不齐是因为窦房结发出的不完整的讯息而引起的一种常见的心律不整。
不过这种情况一般都是属于呼吸性窦性心律不齐，是一种很常见的生理反应。其特征在于呼吸发生改变时，心率会增加，可以放慢呼吸速度，心跳频率和速度循环正好与呼吸循环相对应，当停止呼吸时，心率就会变成正常的。这个窦型心律失常会伴随呼吸而改变，是非常常见的，无需担忧或特别处理。所以对于被确诊为窦型心律失常的患者，要留意自己的心跳是否加快和减缓与自己的呼吸的联系，没有其它的表现就不用进行任何的处理，正常的生活、工作、学习都可以正常进行。