这要依据个人对疼痛的敏感性，大部分女同志做膀胱镜检查时，并不会感觉疼痛，但也有少部分女性对疼痛很敏感，会感觉很痛苦。因膀胱镜属于有创性检查，男性尿道细长，有生理弯曲，有先天狭窄，所以在做膀胱镜时会很痛苦，但因女性尿道的解剖特点，尿道短直而且相对较粗，所以在做膀胱镜时并不会造成很大的损伤，也不会引起很重疼痛。
做膀胱镜疼不会很疼，做膀胱镜的费用在200元到500元之间。膀胱镜是内窥镜的一种，形与尿道探子相似，电镜鞘、检查窥镜、处置和输尿管插管窥镜以及镜芯四部分构成一套，并附有电灼器、剪开器和活组织检查钳等附件。
膀胱镜检查属于一种有创检查，它对膀胱的黏膜、尿道的黏膜都不可避免地会有挫伤。所以，检查的时候疼痛、酸胀不适是会有的。特别是男性病人，由于尿道比较长，因此不适感会比较明显，女性患者会适当的减轻一些。
如果做膀胱镜疼痛明显，先口服止痛药物或者缓解膀胱痉挛的药物，然后检查疼痛病因。最常见病因应该是泌尿系感染或者泌尿系结核，得做清晨第一次尿的中段尿菌培养及药敏，根据药敏试验结果对症下药。
小便时膀胱区、会阴区、尿道的疼痛均可称为尿痛。尿痛常由膀胱炎、急性下尿路感染、尿道炎引起，并伴有尿频、尿急等症状。部分前列腺炎或前列腺病变患者也可以引起尿频、尿痛的症状。临床上常做规范性检查，包括尿常规、超声检查等，同时进行膀胱结石、肿瘤等筛查。另外，若患者有阴囊潮湿的症状，需进行前列腺液常规化验。
憋尿是一种坏习惯，它会导致泌尿系统的感染，所以尽量以后千万不要憋尿饮食清淡有营养，三餐规律，避免吃辛辣生冷油腻的食物，适当的多喝水，做个B超和尿常规检查，排除是否有泌尿系统的炎症。
