药流不干净后清宫是会疼痛的：
无论是人工流产的刮宫还是药流的清宫都是挺疼的，因为要用负压吸宫去吸子宫腔里的东西，但现在有无痛技术，当药流流不干净而做清宫时，也可以在静脉全麻下做清宫，这样能减少疼痛。
日常生活中，建议清宫后的女性注意保暖，不要吹冷风、碰凉水，并且注意保持外阴部清洁卫生，每天用温开水清洗1-2次以防止感染。
药流没有流干净会导致宫腔内感染，引起宫腔粘连。药物流产是针对怀孕49天内要求终止妊娠不想人工流产而选择的一种方式，药物流产胚胎组织排出以后，一般流血十天左右就会干净，超过14天还不干净，要B超检查看是不是药流残留，也就是药流不全。宫内组织残留的，看看它的大小，如果是组织大于1cm的话，建议要进行清宫。如果不进行清宫的话，影响子宫收缩，而且还有可能会导致宫腔内感染，组织停留在宫腔时间长的，组织会极化，也会影响宫腔，引起宫腔粘连，还会引起子宫内膜异位症、子宫内膜炎、盆腔炎、不孕不育等。建议患者及时到妇产科检查，注意休息，不要做剧烈的运动，平时也不要过度劳累，饮食上要适当的清淡。
药流不干净需要清宫，需要根据实际情况判断。
药流指的是药物流产，主要是通过服用流产药物完成流产的一种方法。药流不干净，如果可以通过药物刺激缩宫来排出剩余的残留组织，不需要清宫。如果药物效果不佳，则需要清宫。
患者保持良好的个人卫生，多休息，避免剧烈运动和过度劳累，清淡饮食，饮食营养要均衡，适量吃新鲜的蔬菜和水果。
药物流产不彻底做清宫术会有一定的痛苦。药物流产没有彻底清除，做清宫手术的时候，每个人的痛苦都不一样，药物流产后，服用药物后，宫颈口会有很大的膨胀，扩张宫颈不会有任何的痛苦，但是如果是负压的话，用刮匙刮宫的时候，会有一些痛苦。
如果想要减少痛苦，可以采用无痛清宫术，因为无痛清宫术是在病人昏迷状态下进行的。
药物流产会有大约15天的不规则阴道出血情况，出血时间也是因人而异的.但如果药物流产超过2周还没有停止出血，而且出血量没有减少，这有可能是药物流产不全所引起的。应该立即到正规的医院进行检查。
药流不干净进行清宫，有可能会引起子宫内膜的损伤或者是宫腔粘连，但是如果不清宫，损伤是更严重的，容易引起大流血或者是宫腔里的感染，这种感染引起的宫腔粘连是更严重的，一定要权衡利弊。