阴茎短小根本的原因是遗传基因的影响。另外包皮过长会阻碍阴茎的发育。后天性的阴茎短小，主要是因睾丸萎缩引起，青少年发育期间摄入的锌原素、雄性激素、维生素E和相关蛋白营养不足，缺乏后天能量补充，起不到壮大性器官的作用。
阴茎短小可以做阴茎延长增粗手术的，可减少压力，但要有手术的适应症。选择正规的医院进行阴茎延长增粗手术，术后效果较好。平时可做增长阴茎运动，每天自我锻炼，一手摁住茎根，一手捏住龟头往上拉，反复多次。
阴茎短小跟先天性的遗传因素直接的关系。如果想进行治疗，可以考虑通过手术的方法进行治疗。如果阴茎在勃起后大于10厘米是属于完全正常。还有就是体重的过度肥胖的病人。也可以造成阴茎短小的情况。
可以使用补肾益气的药物进行调理，注意戒掉手淫不良习惯，规律适度性生活，注意休息，不要熬夜劳累，可以吃韭菜，羊肉及牡蛎等进行食补，加强体育锻炼。出现性能力下降及无性快感等症状，是平时频繁过度手淫导致肾气亏虚而引起的不适。
有部分男性的阴茎会比正常人要短，在进行性生活时，会引起影响夫妻双方的满意度。可选择手术治疗的方式来扩大阴茎的长度。通过切断阴茎上的短悬韧带和长悬韧带的，来将隐藏在体内的阴茎海绵体分离出来，从而达到延长阴茎的目的。
性生活时间只要不低于二分钟就是正常的，阴茎短小没有什么药物可以治疗。阴茎大小存在个体差异。勃起后长8-16cm，自然状态下长3-5cm，如果勃起小于8厘米，疲软小于3厘米就属于阴茎短小。18周岁生殖器就发育成熟了。如不满意，阴茎延长术是实现成年人阴茎延长的方法，只有手术来治疗。
