进行肛门检查，首先应当选择合适的体位，可选择膝胸位、截石位、弯腰俯卧位，有时也可以采取左侧卧位，选择合适的体位，对检查疾病有很大的帮助。首先应当进行肛门视诊，观察肛门的位置是否有异位变形等。然后观察肛门周围的皮肤及颜色，是否存在着红斑、糜烂、渗出，是否有肿物。
如果是外伤，需要做体格检查和辅助检查。
体格检查主要是看伤口有没有开放性外伤，有没有出血，有没有骨头。需要根据患者的主动运动和被动运动来判断是否有肌腱断裂，神经损伤。同时还要做x片检查，观察骨折有没有移位，要积极的进行治疗。开放性外伤需要清创缝合、抗生素预防感染、骨折复位、加强功能锻炼等。以上方案仅供参考，具体药物使用请在专业医生的指导下使用。
HPV检查不会查艾滋病，HPV的检查主要是检查有没有人乳头瘤病毒的感染。艾滋病的主要是要进行HIV抗体的检测，这是有所区别的。
HPV是人乳头瘤病毒的英文缩写，艾滋病的英文缩写是HIV，所以，如果要想进行艾滋病的检测的话，就需要在窗口期之后进行艾滋病抗体，也就是HIV抗体或者是HIVRNA的检测。检测结果阴性就可以排除。检测结果是阳性的，就可以明确诊断。
一般查体包括基本检查：身高，体重，血压；内科心肺听诊，外科腹部，乳腺，甲状腺等诊查；骨科，五官科，泌尿科，肛肠科，妇科等专科检查；心电图；影像检查：胸片；超声：肝胆胰脾肾，甲状腺，乳腺，颈部血管等。尿便常规化验，血常规，肝肾功能，血脂血糖的化验，一般男性45岁以上，女性40岁以上查肿瘤标志物。其余检查可根据自身疾病情况及要求增加项目。
一般情况下，宫颈检查包括肉眼、化验等检查，具体分析如下：
主要通过肉眼来判定：宫颈有没有发炎、有没有被分泌物所掩盖、有没有分泌液、有没有平滑、有没有肥大、有没有糜烂状变化、有没有息肉、有没有长纳袋等。有没有感觉到疼痛，有没有提起疼痛，有没有触碰的流血。需要做的化验包括：白带常规、宫颈支原体、衣原体培养、TCT+HPV等，如果发现有异常，可以进行阴道内窥镜。以上是子宫颈部的常规检查。
外阴部检查查看阴道黏膜表面是否光滑，质地是否正常，有无出血点，阴道分泌物的性状及气味是否正常。白带常规检查是否有妇科疾病，如患有性传播疾病，先彻底治疗，然后再怀孕，否则会引起流产，早产等危险。宫颈检查确定女性是否患有宫颈炎症，宫颈糜烂和赘生物等，子宫及附件检查查看女性是否会患有子宫肌瘤，卵巢肿瘤，子宫内膜异位症，盆腔炎等妇科疾病。
