一般在12周以后就可以自然消失。如果盆腔的超声检查发现，囊肿内容物不均匀，或者是囊壁有乳头状的改变，这有可能是卵巢的恶性肿瘤，可以先做妇科肿瘤标记物进行初步的排查，对于生理性的卵巢囊肿。
囊肿大部分都是良性的，在怀孕期间不能盲目用药，只能先暂时观察，也有可能子宫慢慢增大，会压迫囊肿不再增长。保持心情舒畅充足的睡眠要增加营养，定期做孕检。
怀孕有囊肿要根据怀孕的周期和囊肿变化情况选择不同的处理方式。
若孕早期检查B超时发现有卵巢有囊肿，通常建议观察为主，因为囊肿大部分是生理性的黄素囊肿，一般在怀孕3个月左右自然消失。若3个月后检查发现囊肿在逐渐变大，则建议等到怀孕4个月左右进行手术治疗，因为怀孕4个月左右胚胎较稳定，此时进行手术相对安全，及时手术能够有效避免卵巢囊肿扭转或恶变。
由于怀孕后体内激素的影响，妊娠黄体囊肿的出现也是正常的。然而，体积通常不是很大，直径不超过3厘米，这是正常的。这将慢慢自行消失。它通常会在大约3个月后消失。因此，女性不要担心。平时，女性必须注意休息，避免挤压腹部，并定期去医院进行彩色多普勒超声检查。如果它慢慢减少并消失，女性会松一口气。
一般情况下，孕妇怀孕时附件囊肿有以下治疗方法：
附件上的囊肿一般就是指的是卵巢囊肿。卵巢囊肿是一种良性病变，有些生理性的囊肿与激素水平有关系，会在月经后自行消失。有些囊肿不能自行消失反而会增大，这种情况一般需要手术处理，一般考虑是腹腔镜下手术挖除。
建议孕妇在孕期注意饮食均衡，多吃新鲜的水果和蔬菜，以此来补充怀孕期间所需要的各种元素，保证胎儿的健康。
卵巢囊肿中医认为主要是由于气血亏虚，湿热邪气结聚所致，一般药物很难治疗好。孕期一般不治疗卵巢囊肿，大多是生理性的黄体囊肿，没有不适不需要处理的。怀孕期有卵巢囊肿不影响胎儿的发育，是需要定期复查的，目前是不需要治疗的。
