肺部有肉芽肿的患者，通常会有呼吸不顺畅的症状，从而会引发咳嗽，而且每次咳嗽的时候，胸部会疼痛，但是凭这些症状是很难断定是否有这病，应该要去做比较详尽的检查，有时候支气管炎也会有类似的症状，所以应该要去正规的医院进行诊断治疗。
一般来说，儿童慢性肉芽肿病有以下症状表现：
1.反复感染：患儿可能会出现耳和鼻周围皮肤湿疹样改变，逐渐进展为化脓性皮炎，还可能会出现瘢痕伴局部淋巴结肿大。
2.肺部感染：肺部是最常见的侵袭部位，一半以上的患儿因肺部感染首发症状就诊，部分患儿还会出现肺部反复感染的情况。
3.皮肤感染：部分患儿会出现皮肤破溃、化脓、局部肿块等症状表现。
4.肛周脓肿：肛周脓肿也是患者的典型症状表现，而且迁延不愈。
肉芽肿性前列腺炎有严重的下尿路感染症状，如发热、寒战、尿频、尿道烧灼感、尿痛，偶见血尿、会阴痛、耻骨上不适。多喝水，不要憋尿，适度性生活，禁忌腥辣刺激的食物，不能喝酒。
肉芽肿性前列腺炎症状是83%的病人有严重的下尿路感染症状，如发热，寒战，尿频，尿道烧灼感，尿痛，偶见血尿，会阴痛，耻骨上不适。肉芽肿性前列腺炎肿块一般发展较快，结节较大，有弹性，不规则，软硬不一致。
常见的临床症状有寒战、发热、尿频、尿急、尿痛及排尿困难，甚至发生急性尿潴留。直肠指检可扪及前列腺有多发或单发硬性结节。近期发生急性尿路感染，继而下尿路梗阻，同时前列腺迅速增大、变硬，出现硬结。
多发生在男性阴茎体、龟头、冠状沟及包皮的极小疱、溃疡、常为单个，有时数个，无明显症状，数日不愈，愈后不留瘢痕。亦可发生于肛周，口腔等处。男性腹股沟淋巴结肿，疼痛，压痛，粘连，融合，可见腹股沟韧带将肿大的淋巴结上下分开，皮肤呈出槽沟状。