多发生在男性阴茎体、龟头、冠状沟及包皮的极小疱、溃疡、常为单个，有时数个，无明显症状，数日不愈，愈后不留瘢痕。亦可发生于肛周，口腔等处。男性腹股沟淋巴结肿，疼痛，压痛，粘连，融合，可见腹股沟韧带将肿大的淋巴结上下分开，皮肤呈出槽沟状。
肺部有肉芽肿的患者，通常会有呼吸不顺畅的症状，从而会引发咳嗽，而且每次咳嗽的时候，胸部会疼痛，但是凭这些症状是很难断定是否有这病，应该要去做比较详尽的检查，有时候支气管炎也会有类似的症状，所以应该要去正规的医院进行诊断治疗。
肉芽肿性前列腺炎有急性和慢性之分，急性发病突然，有寒战和高热，尿频尿急，尿痛，会阴部坠胀感，可发生排尿困难或急性尿潴留。慢性有排尿改变，尿不净，尿等待，有时分叉，性生活时有尿急感，排尿后和便后常有白色分泌物排出，俗称滴白，性功能减退，如阳痿，早泄等。
有尿频、尿痛，尿急、夜尿增多、急迫性尿失禁、排尿无力、尿线变细和尿滴沥、血尿及尿潴留。尿道灼热，下腰部和会阴痛，腹股沟、睾丸和耻骨上放射痛等症状。肛门指检前列腺增大、硬坚、固定，但压痛不明显。会阴或经肛门穿刺前列腺组织活检可确诊。
表现为严重的下尿路感染症状，如发热、寒战、尿频、尿道烧灼感、尿痛，偶见血尿、会阴痛、耻骨上不适。肉芽肿性前列腺炎肿块一般发展较快，结节较大，有弹性，不规则，软硬不一致。
肉芽肿性前列腺炎的临床表现都较典型，普遍都有反复发作的下尿路感染病史，部分有前列腺创伤史或过敏性疾病史。常见的症状有寒战、发热、尿频、尿急、尿痛及排尿困难，甚至发生急性尿潴留。