频繁的使用红光治疗仪，也会出现一些危害。比如照射时可以导致皮肤粘膜的破损，另外由于红光治疗仪的温度比较高，长时间照射，会造成皮肤颜色上的变化。如果是在出现外伤损伤的情况下，会引起水肿加重的症状。
重度宫颈糜烂就需要做红光，微波，激光等各种物理疗法，再没有其他的好办法，药物对重度糜烂效果不是太好像以上的物理疗法，都可以彻底的治疗宫颈糜烂，如果实在不成就需要做宫颈锥切术。
包皮环切术后这种红光治疗属于物理治疗的一种，促进身体和伤口的恢复，但并不是所有人都适用。到二级以上的泌尿外科手术医院换药，医生要根据伤口的具体情况才能决定是否需要这种物理治疗，注意避免饮酒。现在都是免拆线的，一般两周左右恢复正常。
带状疱疹是水痘带状疱疹病毒感染导致的，这个病具有自限性，一般2到3个星期的时间会痊愈，但是如果治疗不及时，可能会遗留带状疱疹后遗神经痛，疼痛比较严重的情况下，尽量是照一下红光，如果疼痛不严重可以不用照射。
如果睾丸炎的问题存在，一个睾丸通常会有明显的肿胀和疼痛。病人可以考虑在普通公立医院进行泌尿外科手术，并进行睾丸彩色多普勒超声检查以明确诊断。治疗期间注意清淡饮食。不要吃刺激性食物。及时口服抗炎药物。红光疗法没有必要。
包皮手术后，有必要挂水和注射消炎药物，以防止术后感染。此外，如果在红光治疗中存在龟头局部水肿和炎症，也可以进行红光治疗。包皮手术后切口恢复良好，无水肿，无感染，无红光治疗，只需口服抗生素药物即可预防感染。
