治疗要明确是那种疾病再进行治疗，可以到正规医院内分泌科或外科就诊检查，根据病情采取激素类药物、手术、放疗等方法治疗。甲状腺-肾上腺皮质激素、性激素替代疗法，适用于全垂体功能衰退引起的多腺体功能减退者。垂体性闭经-手术和放射疗法垂体性闭经-食疗。
脑垂体功能下降导致的闭经，可能是由于腺垂体激素分泌减少，引起卵巢激素分泌不足，所以导致垂体性闭经。可以补充外源性的激素进行治疗，或者用中医中药进行调理。中医多认为是由于肾精不足导致的，可以用补肾固精的中药治疗。
脑垂体闭经不可以促排，闭经可能由疾病引发，也可能由生殖器官不健全引发，总之引发闭经的原因比较多，闭经是会导致女性不排卵，从而引发不孕症，所以对闭经的情况必须要及时的治疗。
女性40岁停经是属于不正常的，首先要查明停经的原因。首先，排除怀孕的可能，抽血化验血hcg值来明确。其次，考虑是否出现激素紊乱，查性激素六项和妇科彩超以明确诊断。最后，还要考虑是否为卵巢早衰出现闭经，使其提前进入绝经期。
闭经的病人在治疗时吃点有营养的食物比较好。比如有八宝粥、姜丝炒墨鱼等，八宝粥可以健脾益气，是专门适合闭经的病人吃的食物。还有就是姜丝炒墨鱼，可以形血通经，还可以治疗气血瘀滞型闭经。还有闭经病人要注意休息。