肾脓肿的治疗费用在1万-3万元左右，由于每个地区，每个医院的收费标准不同，技术成本不同。由于病情的严重程度不同，治疗费用也是不同的。需要根据患者的病情以及患者的体质来确定治疗方法，这样才能够确定下来具体的治疗费用。越早治疗，花费越少。
肾脓肿多和细菌感染有关的，如果是普通的细菌感染，则属于比较容易治好的，如果是结核分枝杆菌所致的改变，则治疗比较困难的，疗程通常要半年以上的，这种疾病的治疗，应该先判断感染的病原体，然后选择合适的药物治疗的，多需要配合做引流治疗的，治疗后，多不会复发的。
白酒，对于多囊肾病人来讲宜戒掉，酒类对与肾脏的刺激性优为重要。避免高蛋白食品：每一种肾病，都应该低蛋白饮食，避免体内氮类代谢物合成，减轻肾脏的排泄力。如大豆、豆腐、以及其他豆类制品。适当的锻炼身体以增强体质。饮食上要少喝酒及刺激性、高脂肪的食物。
肾脓肿的治疗，应该先判断感染的病原体，然后选择合适的药物治疗，疗程通常要半年以上，需要配合做引流治疗，治好后，多不会复发。另外平时饮食要清淡，不要吃辛辣刺激的食物，注意合理睡眠。
平时可以多吃些有利尿作用的食品；碱性食物亦多服用，能起到治疗辅助作用。严禁患有肾囊肿的病人食用像酒类饮料、发酵性食品、高蛋白食品、内脏食品、咖啡、巧克力等食物。