扁桃体炎分为急性期和慢性期。急性扁桃体炎主要是抗炎抗感染等治疗，若是口服抗感染药物或者是使用静脉注射抗生素治疗，扁桃发炎一年超过三次或引起打鼾症状，可考虑手术切除。
扁桃体咽喉炎症应采取全身治疗，辅以含漱剂、超声雾化或蒸气吸入等局部治疗。慢性炎症则以局部治疗为主。可以采用口含片、含漱剂等综合治疗，以增强疗效，并进行病因治疗。
扁桃体炎中医可以使用消炎药物治疗，扁桃体炎可分为急性扁桃体炎和慢性扁桃体炎，患急性传染病（如猩红热、麻疹、流感、白喉等）后，可引起慢性扁桃体炎，鼻腔有鼻窦感染也可伴发本病，病源菌以链球菌及葡萄球菌等最常见。
扁桃体炎患者在急性发作时可以服用消炎药抗炎治疗，同时要注意经常漱口，可以用生理盐水饭后漱口促进扁桃体隐窝内脓栓的排出。还可以配合清热解毒利咽消肿类的中药中成药，比如金银花，蒲公英，玄参麦冬，牛蒡子桔梗等泡水或者煎汤服用。
儿童扁桃体炎可以使用药物来治疗，具体内容如下：
儿童扁桃体炎一般分为急性扁桃体炎和慢性扁桃体炎。急性扁桃体炎多是由病毒感染引起的。治疗上可以给宝宝口服蓝芩口服液、板蓝根冲剂等中成药，或者服用银黄含片、草珊瑚含片等。或者给宝宝局部喷咽喉剑和西瓜霜喷雾。链球菌感染也可能引起急性扁桃体炎，应给予青霉素、头孢菌素等抗生素治疗。如果宝宝伴有发热、咳嗽等症状，要对症治疗。对于发热者，可给予布洛芬混悬液或对乙酰氨基酚退热，并给予宝宝大量饮水、清淡饮食和休息。如果宝宝经常反复急性扁桃体炎，已经严重影响了宝宝的睡眠、饮食、生长发育，并有心肌炎、肾炎等并发症，可以考虑给宝宝做扁桃体切除术。
儿童扁桃体炎需要做口腔检查和咽部检查，一般会出现扁桃体红肿，如果是化脓性扁桃体炎，扁桃体表面有脓点，一般可以通过体格检查来确诊。儿童容易患扁桃体炎，如果患儿出现发烧、诉咽痛、或者年龄较小的婴幼儿进食不良、进食时哭闹等症状，应及时到医院检查。儿科医生会用压舌板检查孩子的咽喉，扁桃体充血、水肿、肿大、脓性分泌物等，提示化脓性扁桃体炎。
