阴茎短小的治疗方法包括生理性阴茎短小，多见于耻骨联合部、会阴部脂肪较多的男性，可通过手术治疗，去除多余的脂肪，使阴茎得以延长至正常长度，病理性阴茎短小，染色体异常、克氏综合征、卡尔曼综合征导致的阴茎短小，应及时就诊，明确病因，对症治疗。
阴茎短小根本的原因是遗传基因的影响。另外包皮过长会阻碍阴茎的发育。后天性的阴茎短小，主要是因睾丸萎缩引起，青少年发育期间摄入的锌原素、雄性激素、维生素E和相关蛋白营养不足，缺乏后天能量补充，起不到壮大性器官的作用。
根据孩子的症状，应该属于假性隐匿性阴茎，有可能是先天发育异常造成的，也有可能是孩子肥胖等原因造成的。对于孩子现在的情况，是不需要进行治疗的，如果青春期后还有隐匿性阴茎的症状，可以手术进行治疗，你家孩子要合理喂养，适当的补充维生素D。
可以吃的，阴茎短小并没有特别的忌口，且瓜子含丰富的脂肪油，其中有亚油酸、磷脂、β-谷固醇等，又含蛋白质、糖类、柠檬酸、酒石酸、绿原酸等有机酸及胡萝卜素等。瓜子富含脂肪、蛋白质、锌等微量元素及多种维生素，可增强消化功能。
阴茎短小跟先天性的遗传因素直接的关系。如果想进行治疗，可以考虑通过手术的方法进行治疗。如果阴茎在勃起后大于10厘米是属于完全正常。还有就是体重的过度肥胖的病人。也可以造成阴茎短小的情况。
