唇腭裂的治疗主要是通过整形来恢复口腔内的结构以及面部的畸形。但是选择什么样的手术方式以及手术时间还需要根据唇腭裂的轻重程度来考虑。最终的治疗目的是改善腭裂，恢复软腭的生理功能。术后还需要进行语言的训练来形成正确的发音。长大一些还需要到口腔科进行牙齿的矫正治疗。
家长要保证患儿的营养和正常发育，避免呼吸道感染，以使患儿在全身健康状态下接受手术。若新生儿的裂隙很宽，或双侧唇裂者前颌高耸，家长需要尽早与医院联系，医生可根据情况给予必要的指导，或提前采取一定的措施以利于手术的进行。
主要病因有：母亲怀孕早期感染流感病毒、风疹病毒；遗传因素；怀孕期间服用镇静药、抗癫痫药、激素类药或大量接受X线照射等。主要表现为出生后上唇和上颚裂开成两瓣或三瓣，唇裂手术时间为生后3个月。腭裂为生后18个月。
对于唇腭裂患者的最佳手术时间，原则上是越早治疗越好。唇裂手术在患者机体免疫力健全的情况下，最早可在出生后24小时内手术，也可在出生3个月后，因为这时不仅婴儿的免疫力较强，可以耐受感染，而且这时机体的组织细胞也都很幼稚，不易形成瘢痕，为术后畸形恢复，创造良好的条件。而腭裂手术最早也要在婴儿出生后6个月以后进行。
唇腭裂与腭裂是不相同的，唇腭裂包括唇裂和腭裂，而腭裂就是单纯的腭裂。唇腭裂比较严重一些，原因不明确，可能与怀孕期间内分泌紊乱，病毒感染等有一定关系。早发现在治疗。
