临床上大多数尿路结石需要通过手术方法粉碎并排出体外，部分尿路结石可以通过服药自行排出。医生要根据检查结果，判断结石的位置、大小、肾脏积水的程度，对于有机会药物排石的患者，给予药物治疗。
下尿路指输尿管、膀胱开口平面以下，主要包括膀胱和尿道，因此位于膀胱和尿道的结石统称为下尿路结石。下尿路结石需将结石还原到膀胱内，按膀胱结石再进行处理。治疗原则是取净结石，纠正结石成因。膀胱感染严重时，应用抗生素治疗。多饮水，多利尿，防止结石增大，促进结石排出。每天饮水2000ml以上，尤其是睡前或夜间饮水效果更好。
非手术治疗：若结石较小，可采用体外冲击波碎石治疗，碎石一次费用约5百-6百元。另外，也可采用物理振动排石治疗，一次费用约1千-2千元，手术治疗：输尿管结石治疗费用为8千-1万2千元，肾结石如果采用输尿管软镜进行治疗，费用约3万-4万元。
若结石较小，可采用体外冲击波碎石治疗，碎石一次费用约500-600元。另外，也可采用物理振动排石治疗，一次费用约1100-1300元。若需要手术治疗，输尿管结石治疗费用为8000-12000元，肾结石如果采用输尿管软镜进行治疗，费用约30000元，采用经皮肾镜治疗，约20000-30000元。
一般情况下，肾结石和尿路结石的治疗方案需要根据结石的情况进行判断，具体内容如下：
如果患者有肾结石，但其直径不超过0.6cm，患者可以通过服用药物、多饮水、多运动等方式来进行调理，以促进结石排出。如果肾结石直径超过0.6cm，但未超过2cm，患者可以通过激光碎石来进行治疗。当肾结石直径大于2cm时，则需要行经皮肾镜取石术。而尿路结石通常需要通过体外冲击波碎石、输尿管镜碎石等方式进行治疗。
