头部疼痛可以做CT检查，也可以做磁共振检查。做CT检查费用要低，但是存在一定的辐射，如果是孕妇或者小朋友，最好不要做CT检查。磁共振检查费用要高的多，但是清晰度比较好，做磁共振检查是在比较强的磁场里面，身体里面有钢钉、钢板或者心脏起搏器之类的东西也不能做检查。做磁共振检查是在空间比较大又比较幽暗的房间里面做，如果病人有幽闭综合征也不能做磁共振检查，只能选择做CT检查。建议到神经内科检查，在医生的指导下治疗。日常注意多休息，保持充足的睡眠，多喝水，注意保暖，避免着凉感冒。
一般来说，脑梗头痛做CT。具体分析如下：
脑梗头痛完善头部CT检查，这种检查能迅速成像，为治疗争取时间。脑梗常伴有活动不灵活、感觉麻木、头晕、头痛等症状。治疗时，患者可以在医生的指导下使用降纤药物、溶栓药物、抗凝药物等药物进行治疗。
日常生活中，应当注意养成规律的生活习惯，戒除烟酒，可以进行适宜的体育运动锻炼，有助于增强体质。
在临床中，出现头部疼痛的症状，可以做CT检查，也可以做磁共振检查，这两种检查方式都有自己擅长的一面。如果怀疑头部里面有脑出血，最好做CT检查。如果怀疑头部里面有梗塞，或者是脑白质方面的问题，需要做磁共振检查。当然，如果身体里面有金属、安装有心脏起搏器之类的东西，不能够做磁共振检查，只能选择做CT检查。在临床中，磁共振检查的费用比CT要高得多。所以，出现头部疼痛，选择哪种检查方式，还是需要根据病情决定，并不一定价格更高，检查效果就更好，具体问题需要具体分析。根据检查结果再选择治疗方案，要及时处理，以免延误病情。
头痛做核磁共振好，磁共振主要用于检查颅内器质性病变引起的头痛。头痛是一种症状，可由多种疾病所引起。常见的疾病包括颅内器质性病变，也可能是由于原发性头痛疾病所引起。
首先，如果头痛比较剧烈，早期出现喷射性呕吐、意识的改变，这时考虑脑出血的可能，那么做头颅的CT比较好。对于判断脑出血CT好过核磁共振，如果头痛反复发作，突然一侧肢体的麻木和无力，时间在6个小时之内，考虑急性梗塞的可能，核磁共振可以发现超早期的梗死。
血管性头痛应该做核磁共振检查，核磁共振检查对于颅内肿瘤，小脑，脑干及小的病灶明显优于CT，核磁血管成像可以明确颅内较大血管状况比如动脉瘤，动静脉畸形，对脑出血无明显优势。核磁可以发现CT不能发现病变，无辐射，无创伤，价钱高于CT。头痛患者一部分有颅内肿瘤引起。脑动脉瘤，一部分病人也可以出现头痛。