如果腱鞘囊肿患者没有出现明显不适症状，可以不进行特殊的治疗。若出现不适症状或并发症时布不治疗，可能会导致病情加重。
腱鞘囊肿是一种良性的肿瘤，一般不会对人体产生任何的伤害，所以不需要特别的处理。但如果是大关节的腱鞘囊肿，会影响到关节的运动，尤其是扩张之后会压迫到神经血管，那么囊肿就需要进行特殊的治疗，将腱鞘囊肿去除，以消除压迫组织，恢复四肢的运动，缓解四肢的麻痹，改善四肢血液循环。
腱鞘囊肿多数病例不导致明显症状，因此，没有必要进行特别处理，但必须主动重视休息，忌重复推拿按摩局部。
一旦出现了较大的积液就应该及时就医检查。若更小，很可能自己就没了。一旦出现了巨大型的或者较大型的腱鞘瘤，则很容易导致患者发生严重的疼痛等一系列的不适，因此必须及时的去医院就诊，明确诊断后才能对症治疗。如囊肿较大，多数时候，失踪的概率较低，需主动操作。
不治疗的话是不会自行消失的，治疗的方式主要取决于腱鞘囊肿的大小。如果比较小，对于关节活动没有影响，可以进行保守治疗。如果腱鞘囊肿比较大，对关节的活动有影响就需要进行手术治疗。
通常情况下，腱鞘囊肿中医可以通过使用药物、针刺治疗等方式进行治疗。具体情况分析如下：
使用药物：腱鞘囊肿中医治疗时，可以安静消炎镇痛膏、麝香止痛贴膏、云南白药膏等把膏药敷到患处，可以起到消肿化脓、活血行气的作用。
针刺治疗：腱鞘囊肿中医治疗时，根据囊肿的部位及症状，选择合适的穴位，可以很好的治疗腱鞘囊肿。
脚踝腱鞘囊肿可以通过针刺、药物治疗等方式改善。
脚踝腱鞘囊肿要根据囊肿的体积和局部的压力来决定，如果囊肿很小，直径小于2cm，可以采取保守疗法，比如在外用热敷，可以用针刺，进而可以对局部进行封闭，但是对于大的腱鞘囊肿，或是压迫到了周边的神经动脉，引起了足趾的麻木和痛苦。这时需要进行药物治疗，起到止痛的作用。