治疗要明确是那种疾病再进行治疗，可以到正规医院内分泌科或外科就诊检查，根据病情采取激素类药物、手术、放疗等方法治疗。甲状腺-肾上腺皮质激素、性激素替代疗法，适用于全垂体功能衰退引起的多腺体功能减退者。垂体性闭经-手术和放射疗法垂体性闭经-食疗。
下丘脑垂体性闭经是由于下丘脑激素分泌异常导致的闭经。一定要在第一时间去治疗才行，可以尝试使用激素治疗的方法或者是药物治疗的方法，或者是中医针灸治疗的方法。平时注意卫生，避免辛辣刺激的食物。
脑垂体功能下降导致的闭经，可能是由于腺垂体激素分泌减少，引起卵巢激素分泌不足，导致垂体性闭经。可以补充外源性的激素进行治疗，或者用中医中药进行调理。中医多认为是由于肾精不足导致的，可以用补肾固精的中药治疗。
试管受精一般会导致卵巢早衰。
由于试管受精需要使用大量的促排卵药物和取卵，而促排卵的时候会消耗大量的卵泡，在取卵的时候会对卵巢造成机械损伤，这会影响到卵巢的血液循环，导致卵巢功能降低。如果是老年妇女，会有卵巢储备卵巢的减少，如果在这个情况下使用大量的促排卵药物，会加快生殖细胞的消耗，从而导致卵巢功能的退化。
闭经后如果检查发现卵巢功能已经衰竭，可能不能做试管婴儿；如果卵巢功能正常，可以做试管婴儿。如果在促卵泡生长素两次检查中，结果均大于40mIu/mL而且女性的年龄在35岁以上，可能是卵巢功能已经衰竭，这种情况下试管婴儿的成功率较低，所以不建议做试管婴儿。如果女性的促卵泡生长素正常，并且年龄在35岁以下，可以用药改善卵巢功能后，进行试管婴儿。
