肛肠镜检一般不会引起疼痛，但会有下腹部及肛门处胀胀的感觉病人可以耐受。镜检时会在肛门镜外壁涂抹石蜡油起到润滑的作用，方便镜子进入肛门。但如果肛门有病变，如肛裂、肛周脓肿、外痔及内痔炎症感染时，肛门镜检会因肛门镜摩擦病灶而出现疼痛不适。尤其是肛裂病人疼痛剧烈，原则上该类不予肛门镜检。
不麻醉会有一定的疼痛感，如果紧张可以选择在麻醉状态下做。膀胱镜检查是将膀胱镜经尿道插入膀胱，以直接观察膀胱和尿道内病变的检查方法。手术中，需要放松心情，女性病人和用扩阴器做妇检一样，镜头可沿着尿道的生理弯曲度自然地进入，观察膀胱各个部位的病变从而进行检查。
小孩头痛需要做血常规，尿常规，大便常规，脑脊液检查，头颅CT，24小时动态脑电图，核磁共振，头颅X线，鼻窦瓦氏位片。除外一下颅内占位，癫痫，脑炎，鼻窦炎等疾病。头痛是指头部的痛觉感受器受到物理因素和生物因素的刺激引起的一种症状。
肠镜检查一般无明显不适。对肠镜前需要完善肠道准备，检查前3天尽量少渣饮食，食用米粥，面条等好消化的食物，检查前1天开始应用果导片导泻，检查当天不要吃饭，也不要喝水，一边喝一边适当活动，有助于肠道的蠕动，促进大便的排出。
做气管镜检查的时候，会有一定的不适感，但是，针对这种不舒服的感觉可以采取局部麻醉，使声门及会厌部的不舒适感减退，如果仍无法耐受时，也可采取全身麻醉后再做气管镜检查。
