脑干出血后遗症多会表现为颅神经异常，眼球活动异常，眼球内收障碍、外展障碍，瞳孔可能也会出现异常，如果影响三叉神经脊束核，患者会出现改面部感觉异常，如果影响到面、舌神经核，可以出现面瘫，主要是中枢性面瘫，还有舌瘫伸舌偏向一侧。如果影响了双侧锥体束，患者会出现肢体无力、偏瘫。如果双侧受累就会出现四肢瘫。总之脑干的后遗症的临床表现，主要根据受损部位的不同而表现不同。
脑干出血如果超过了5毫升几乎没有生存可能，出血在3毫升以下，而且患者没有应急性溃疡、肺内感染等并发症，患者的年龄在60岁以下，应该能够生存，如果患者的基础疾病多又处于高龄的状态，即使脑干的出血量很少，患者的预后也不会太好，高血压导致的脑干出血，如果血压控制不好，都会在急性期引发再次出血，这样生命就不能维持。
脑干的损伤，是否能苏醒、何时苏醒都是不能预测的。对于低血压患者饮食营养方面应给予高营养、易消化和富含维生素的饮食：适当补充维生素C、维生素B族和烟酰胺（维生素PP）等。
一般脑干少量出血就可以引起严重的症状。多数脑干有10毫升-20毫升出血，就可能会引起死亡。脑干又称为人的生命中枢，管理着人的呼吸、循环等相关的生命支持的重要功能。
脑干出血患者的清醒时间主要取决于出血量的多少。如果出血量大约10ml，患者基本上没有清醒的可能性。因为在临床上脑干出血大于10ml，死亡率是接近100%。如果脑干出血量比较小，经过积极的保守治疗，比如脱水降颅压、清除氧自由基、护胃、营养神经等处理，一般在1周之内能够清醒。对于中等脑干出血的患者，早期经过积极的保守治疗，后期待病情稳定一般需要3周左右。
主要取决于脑干出血的量。如果脑干出血量比较大，有可能会在住院期间即发生死亡。对于脑干出血能够存活，如果出血量比较小，早期积极康复治疗，有可能得到完全康复。
