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跑步后膝关节疼痛可能是未热身、膝关节损伤等原因导致的，具体分析如下：
1.未热身：跑步后膝关节疼痛可能是未热身导致的，跑步运动锻炼前让关节适应性活动，包括髋关节，就是下肢热身让肌肉处于亚兴奋状态，然后再去跑步。
2.膝关节损伤：跑步后膝关节疼痛可能是膝关节损伤导致的，可能是因为长期运动性锻炼造成的膝关节的慢性运动性损伤，建议患者通过休息、局部热敷等方式缓解症状。
跑步膝关节疼痛一般是膝关节磨损引起的。
剧烈的跑跳会导致膝关节周围的韧带、内部的交叉韧带、膝关节内部半月板过度受力，刺激膝关节内部的滑膜从而引起韧带、滑膜以及软骨的水肿和半月板的损伤，导致膝关节出现酸胀疼痛，在短期活动时疼痛明显加重。出现疼痛以后，近期应该减少运动，给水肿的组织创造修复的条件。日常生活中也要注意膝关节的保暖，强烈不适时建议及时就医。
跑步后膝关节疼痛可以从以下三方面进行改善：1、适度运动：如果因为跑步出现了膝盖疼痛的情况，可暂停运动，让膝盖得到休息，疼痛感较强可以选用敷贴或药物来舒缓；
2、就诊：如果疼痛感已经严重影响到工作和生活，并且用药也无法缓解疼痛，这种情况要尽早到正规医院治疗，先拍片看病情程度，再根据具体情况选择合适治疗方式，如果是半月板撕裂的情况是需要手术治疗的。
运动后膝关节疼痛可以口服非甾体类消炎镇痛药物。具体方法有：
1、单纯的锻炼后出现的疼痛，可以通过适当的休息来减轻。
2、局部肿胀，不影响日常生活和关节活动，局部可以通过冰敷等方式来减轻炎症，同时可以佩戴护具。
一旦发生了运动伤害，首先要做好充分的休息和保护，如果有红肿，可以进行冰敷，同时也可以使用活血化瘀的药物，但是局部有创面一定要避免外用，同时要注意是否有过敏反应，不能长期使用
膝关节疼痛不舒服，这个原因很多，也比较复杂，需要检查了确定，比较多见的原因比如半月板损伤，退行性变引起的骨关节炎，骨肿瘤，化脓性关节炎，关节结核，痛风，风湿等。这个可以考虑膝关节的地方拍片，另外就是磁共振检查，必要时可以考虑进一步检查血常规，血沉，C反应蛋白，尿酸等指标的，不同的原因治疗的方法不一样，如果是这个半月板损伤，局部可以热敷，贴膏药比如骨痛贴等，严重的三度损伤需要手术。
膝关节在下蹲的时候，因为关节对关节面的挤压特别厉害，所以这个时候关节内如果有组织有损伤就很容易发生疼痛。膝关节疼痛的原因比较多，可以到医院就诊，找清楚疼痛的来源，对症性的治疗。
