实际上许多复发阵发性房颤并无确切病因，即特发性房颤（简称特颤），这可能与遗传及一些房颤易感基因有一定关系。比较多见的原因包括：高血压、瓣膜病、甲亢、心脏外科手术、慢性肺部疾病、心力衰竭、心肌病、冠心病、先天性心脏病、肺动脉栓塞、心包炎、及并发其他类型心律失常等。常见房颤诱因：可伴有饮酒、紧张状态、电解质或代谢失衡、严重感染等。
心房颤动的病因有很多，可见于一些正常人在情绪激动手术后，运动或大量饮酒时发生。心房颤动还常见于心肺疾病的病人，例如风湿性心脏病，冠心病，高血压心脏病，甲状腺功能亢进，缩窄性心包炎，心肌病，感染性心内膜炎，以及慢性肺源性心脏病等合并心肺系统的疾病。
心房纤颤最常见的病因是冠心病。还有高心病，肺心病，心肌病变，都会导致房颤。过度劳累紧张，休息不好，睡眠不足，也会出现房颤的情况，也可发生在无心脏病的青年中，即孤立性房颤。某些发生急性缺氧、高碳酸血症、代谢或血流动力学紊乱时也可出现房颤。
持续性房颤的治疗涉及到其病因的治疗。与甲状腺功能亢进一样，甲状腺功能亢进可引起持续性房颤，因此治疗甲状腺功能亢进有助于持续性房颤的治疗。控制心室率，重建窦性心率，预防栓塞。由于地高辛能增加房室传导的延迟和阻滞，故通常可通过地高辛控制心室率。例如，独自地高辛不够有效。维拉帕米(维必定)最有效。
心房颤动治疗强调长期综合管理，即在治疗原发疾病和诱发因素的基础上，积极预防血栓栓塞、转复并维持窦性心律及控制心室率，医生会根据病因、临床症状不同等给予药物、手术或者射频消融治疗等不同的治疗方案。
对于已不适合药物转复或药物及电复律转复失败的老年患者，治疗目的则是控制心室率。目前常用药物有洋地黄、β受体阻断药、钙通道阻断药、胺碘酮等。中医药对房颤的主要干预手段有药物治疗、针灸疗法等，例如参附注射液，温补心阳，安神定悸。用于心阳不振所造成的心慌不安、胸闷气短。
