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细菌感染通常使用的抗生素为头孢类或青霉素类，具体视病情严重程度而定，亦可用中药消炎治疗。
细菌感染是致病菌或条件致病菌进入血循环中进行生长繁殖，产生毒素和代谢产物引起感染。如果是重症患者，用中药副作用就比较小了。如果出现发烧、咳嗽等症状，可先服用退热药。注意，平时要多喝水。感冒后，要及时服用退热药和止咳剂等药物。注意休息、不熬夜，饮食宜清淡，不吃生、冷、辣、刺激的食品，帮助身体康复。
细菌感染通常是一定要用抗生素的。
在使用抗生素要在医师的指导下使用，不能确定是什么原因导致了菌群的紊乱，但是出现了细菌感染就必须使用抗生素，常见的抗生素有头孢拉定，头孢氨苄，红霉素，阿奇霉素，罗红霉素、头孢克圬，头孢曲松、庆大霉素，妥布霉素，阿米卡星等。有些感染，不能立即使用抗生素，会导致全身的炎症，严重的还有感染的情况。
没有细菌感染一般是不建议吃抗生素的。
没有细菌感染时吃抗生素会增加机体对抗生素的耐药性，还会导致副作用的出现。如果出现发热、咳嗽、咳痰等症状，或者是恶心、呕吐、腹痛、腹泻等表现，或是尿频、尿急、尿痛等症状都建议去正规医院做相应的检查，比如血常规、尿常规、C反应蛋白、PCT(降钙素原)、胸部CT等来分辨是细菌还是病毒感染，然后在医生指导下给予针对性的治疗。
如果孩子是细菌感染所导致的肺炎，必须使用抗生素，如果孩子是属于非常轻微的肺炎，可以考虑口服抗生素治疗也是可以的。常用的抗生素包括头孢类的药物，或者是青霉素一类的药物，例如头孢克肟颗粒，头孢克洛干混悬剂和头孢羟氨苄，阿莫西林等，这些均是可以的。
通常生殖细菌感染用抗感染的药物较好。
如果是泌尿系的疾病，可以选择诺氟沙星、左氧氟或头孢等抗生素，但需提前进行药物敏感性实验，并根据医生的建议规范用药。在这个治疗过程中，病人要避免吃一些辛辣刺激性的东西，保证饮食清淡，有助于达到较好地治疗效果。
