儿童治疗软疣首先应去除软疣再进行药物治疗，不能自愈。
软疣多数临床表现为白色半球状丘疹或可挤出白色乳状物质。治疗时可刮除疣体或使用镊子将疣体内物质挤出，再外涂碘酊、酞丁安软膏、西多福韦软膏等，也可以使用冷冻疗法等。平时应避免儿童与人共用洗浴用品和毛巾，避免到公共游泳池游泳等。
儿童软疣的治疗方法药物治疗日常护理，具体分析如下：
对于儿童软疣，最常见的治疗方式就是刮疣，要想完全根治，通常要进行多次的治疗。刮疣的时候会有一定的痛苦，但是如果是小孩子，不能配合治疗。可以选择保守治疗。常用的治疗方法是外用中药外洗，再涂药。鬼臼毒素酊、干扰素软膏等是临床上比较常见的药物。可以服用胸腺肽片、转移因子胶囊等增强免疫力的药物。在治疗的时候要注意衣服的清洁和消毒。
儿童传染性软疣，可以通过刮除、药物治疗等方式进行治疗。
1.刮除：消毒后，将传染性软疣的尖端切开，可见乳酪状的肉瘤，再用钳夹将其挤压出来。
2.药物治疗：家长可以遵医嘱给其使用维A酸乳膏、咪喹莫特乳膏等药物进行治疗，能够腐蚀疣体。
治疗期间，家长应该做好儿童的护理工作，避免搔抓。
孩子患软疣能治，但不能说是根治的。
软疣由痘病毒感染引起、小孩子患的是软疣，大多是由于成人传染小孩子，也许要穿过公用浴巾毛巾，还可通过亲密接触传播。目前多采用局部消毒后处理，用止血钳夹一下，还可利用激光等来打落软疣，接着涂上有抗病毒效果的膏，彻底清除病毒。
软疣是指传染性软疣，儿童传染性软疣可能是与其他传染性软疣患者密切接触而引起的。
传染性软疣是具有传染性的，可传染给他人、也可自身扩散，而传染性软疣患者是重要的传染源，因此儿童的传染性软疣可能是其他传染性软疣患者感染而来的。建议儿童在医生指导下使用抗病毒的药物治疗，同时加强自身卫生护理。
儿童传染性软疣治疗的办法比较简单，现多采取挤压或刮除法，在皮损处常规消毒后，用消过毒的小镊子夹住基底部，然后用力一提，把整个疣体取下来，也可用刮勺把疣体从基底部刮下，然后消毒，一般2～3次就可完全治愈了，如果发生感染，应先控制感染。
