相对而言，同卵双胞胎畸形发生率要高于单胎。
胎儿在子宫内需要母体提供的羊膜囊和胎盘。同卵双胞胎是由一个受精卵在子宫内着床，分裂成两个细胞而发育形成。双胞胎尤其是单绒毛膜性双胎，如果出现两个胎儿共用一个胎盘的情况，容易发生双胎输血综合征，导致胎儿生长受限。如果两个胎儿在一个羊膜囊内，则容易发生脐带交锁，导致胎儿死亡。单胎则是一个胎儿使用一个羊膜囊和胎盘，不会发生上述情况。
因此在确认胚胎为同卵双胞胎之后，孕妇应及早对双胞胎的人绒毛膜性进行检查，方便之后的孕检。孕妇可以在怀孕12至14周进行nt检查，15到20周进行唐氏综合征的筛查，20周以后进行大排畸检查，必要时可以做无创DNA检查。
双胞胎在八个星期左右会有胎心，双胞胎和单胞胎的胎心一般都是相同的。最好不要过早的进行彩超，以免出现胎儿心的问题。怀孕8周后，通过彩超还找不到胎心，可以抽血化验hcg和孕酮，确定是否达到了妊娠周数，第二天抽血化验hcg和孕酮，如果孕酮过低，hcg没有翻倍或下降很快，可以考虑是胎停。在生活当中也应当注意，不要过度的情绪激动，不要吃热性的食物，多吃蔬菜水果。
是怀孕双胞胎，其中一个胎儿是畸形的，那么就需要看看是什么情况，如果真正是很严重的畸形，那么要是流产，两个孩子都会流掉。目前只能观察其变化。确无良策，动态观察两个胎儿的生长发育和活力的变化。
双胞胎10周之内有胎心都是属于正常的，如果超过10周，出现一个有胎心一个没有，那么就提示没有胎心的孕囊出现了胚胎停止发育，此时不需要做任何处理，停育的那个孕囊在后期中会被逐渐吸收。
一个胚胎可能能变双胞胎，具体内容如下：
孪生可以分成两种，一种是同卵双生，另一种是异卵双生。在妊娠42周之前，胎儿尚未分化完毕，可以在同一时间内，在一个胎儿中产生两个卵黄囊，然后通过两个卵黄囊的发育，形成两个孕囊，所以一个胚胎可能能变双胞胎。正常情况下，要做好孕50多天才可以做好胎儿的检测，因为在停经42天之前，胎儿还没有完全分化，所以做B超的时候，会发现囊性暗区。
一个卵泡可以生一对双胞胎。如果有两个非常强大的精子可以同时到达雌性的卵子并进行结合，那么一个卵子就会分裂成两个卵子，从而产生一对双胞胎。
这样的话，双胞胎就会长得很像，都是一样的，不可能是异性。另一种是双卵双胎，即两个卵子同时怀孕，双胞胎的外貌和性别都不一样。建议男女双方在备孕期间，少吃辛辣刺激的食物，忌烟酒，保持充足的睡眠，少熬夜。
