应立即隔离并应用抗生素进行治疗。出现呼吸困难时，应及时吸氧，伴有咳嗽，痰多症状时，可以应用止咳化痰药物进行治疗。百日咳的主要临床表现为阵发性，痉挛性咳嗽，并伴有深长的鸡鸣样吸气性吼声。
百日咳综合症的临床表现通常会先有流鼻涕、流眼泪、发热、轻度咳嗽等，然后慢慢的咳嗽会逐渐加剧，2个星期后会出现抽搐性的连续咳嗽，以夜晚居多，如果病历比较久，会引起声带水肿，并伴有鸡鸣样的尾音，也会有口嘴唇发青、呼吸困难等。通常情况下，一般是见于6个月内白百破疫苗还没有接种完全的婴儿，可以口服阿奇霉素、红霉素等大环内酯类的药物来治疗。
百百日咳是一种由百日咳杆菌引起的疾病，治疗百日咳最主要的就是针对百日咳杆菌进行治疗，可采用抗生素如红霉素，阿奇霉素，克拉霉素来治疗百日咳。同时应针对百日咳的症状作对症治疗，百日咳的最主要症状是咳嗽，可在医生的指导下采用雾化吸入激素的方法来缓解咳嗽的症状。需要注意的是百日咳具有一定的传染性，因此应特别注意采取隔离措施。
按呼吸道隔离，保持空气新鲜，避免一切可诱发痉咳的因素。加强护理以预防并发症，注意营养。幼婴儿窒息时应即刻行人工呼吸，给氧，必要时给予止痉排痰。可用静脉滴注，以减少窒息或惊厥，需同时注意心率和血压。有低钙、低血糖等时，予以对症治疗。抗生素治疗，可降低传染性，减轻症状并缩短病程。
百日咳综合征的症状有有以下几点：
1.咳嗽初期症状与普通感冒相似，但病程较长，治疗相对困难。
2.咳嗽进入痉挛期，孩子咳嗽得很厉害。咳嗽的时候满脸通红，屏住呼吸，会有乌鸦一样的声音。
3.百日咳综合征的症状时轻时重。如果感染了其他病毒和细菌，可能会反复发热。
百日咳综合征是一种与百日咳杆菌感染相似的临床症状，但不是由百日咳杆菌感染引起，可能与腺病毒感染有关。
小孩百日咳的典型症状是阵发性、痉挛性咳嗽，咳嗽终末出现深长的鸡啼样吸气性吼声。一般发病比较缓慢，得病初期有低热和感冒的症状，咳嗽逐渐加重，以夜间为重，一周后出现阵发性一连串痉咳，并伴有吸气性吼声，反复发作，虽然咳嗽严重但是肺部多无异常体征。
