孕期流褐色分泌物的原因如下：
当怀孕后孕囊进入宫腔后，孕胚着床的时候冲破子宫内膜导致的少量出血。这种情况是无需治疗的，一般在一段时间内就会自行痊愈。先兆流产症状。先兆流产是妊娠28周前出现的少量阴道流血，常为暗红色或血性白带，无妊娠囊排出，随后出现阵发性下腹痛或腰背痛。胚胎在与子宫壁着床部位有毛细血管断裂，就叫先兆流产。
孕期褐色分泌物可能是先兆流产或宫外孕，需及时到医院进行检查。
1.宫外孕：患者可能是宫外孕，当受精卵逐渐发育，导致周围组织受到压迫，从而受损出血，引起孕早期有褐色分泌物的问题。
2.先兆流产：患者可能是因为因为剧烈运动，或者是生活习惯导致先兆流产，从而引发子宫出血，引起孕早期有褐色分泌物。
孕早期有褐色分泌物说明存在出血问题，孕妇应该及时到医院接受检查，才能够避免发生意外。
如果在早孕的时候阴道有棕色分泌物，一般是由于胎儿发育不稳定引起的先兆流产，一般没有怀孕物质排出，但也会出现阵发性下腹痛或者腰背痛，这与胎儿自身染色体异常、母体身体状况、母体内分泌紊乱、生活习惯等因素、过度接触放射性线体等因素有关系，如果宫颈口没有张开，胎膜没有破，可以进行休养，如果出血量增多，需要及时就医，做好保胎。
阴道有褐色分泌物可能是排卵期出血、先兆流产、宫颈息肉等原因引起的。
阴道有褐色分泌物，需要根据患者的年纪，还有出现褐色分泌物的在月经周期中的哪些天来综合考虑原因，育龄期女性，如果是在月经中期出现褐色分泌物，考虑是排卵期出血引起的，排卵后体内的激素波动，子宫内膜得不到足够激素的支持，会导致阴道少量出血，可以不用处理，一般7天左右能自行消失。另外，先兆流产或者是宫外孕也可能会引起这种情况。并且，年纪比较大的患者，要考虑一下是否有宫腔内膜息肉等，需要做子宫双附件B超排除。
孕期有褐色分泌物可能是由于阴道炎症或者是宫颈炎症造成毛细血管破裂，引起出血。这个出血没有及时排出阴道之外，就变为陈旧性出血，那么在流出阴道的时候，就是褐色的分泌物。
怀孕期间出现阴道分泌物发黄的情况，常见的原因是细菌性阴道炎的早期症状。怀孕期间，阴道分泌物增加，如果没有及时清洁，就很有可能造成细菌感染，出现分泌物发黄的情况。孕妇可以用淡盐水清洗后，在医生的指导下使用甲硝唑栓剂在阴道上药治疗，或者口服几天甲硝唑片。孕妇可以去医院进行阴道分泌物病原学检测，根据检测结果，在医生的建议下对症下药。
