此药物的不良反应，没有相关的临床研究资料，所以尚不明确。对此药物过敏者禁用，过敏体质者慎用。风寒感冒，不适合应用此药物。少部分应用此药后，出现恶心、呕吐等症状，出现不良反应，应立即停药。
风寒感冒，用连花清瘟胶囊是误用，不会有效果，还会导致腹痛、腹泻、胃痛、胸闷等。
莲花清瘟胶囊适用于风热感冒、流行性感冒，多表现为流黄鼻涕或不流鼻涕，伴发热吐黄痰。而冬天感冒多为风寒感冒，多表现为流清鼻涕、吐白痰、怕凉。所以用了效果不一定好。
建议：平时应该多喝水，注意休息，还可以吃一点消炎的药平时注意休息，注意天气变，适当加减衣服，以清淡饮食为主，不要吃辛辣刺激性的食物。
连花清瘟胶囊可用于感冒、流感等引起的发热或高热、恶寒、肌肉酸痛、鼻塞流涕、头痛、咽干咽痛、舌偏红、苔黄或黄腻等症状的治疗。在新型冠状病毒感染的常规治疗中，可用于改善轻型、普通型引起的发热、乏力等。
中医讲“异病同治”，是指不同疾病，在发展过程中由于出现了相同的病机，因此可以采用同一方法进行治疗。中医认为，新冠、感冒、流感都属于外感温热病范畴，连花清瘟胶囊的组方涵盖了透表、宣肺泄热、清热解毒等作用的药物，同时具有良好的退热、抗炎、广谱抗病毒、调节免疫的现代药理作用，对于感冒、流感、新冠等疾病均可达到缓解症状、促进病情恢复的效果。
连花清瘟胶囊副作用是烧心。连花清瘟胶囊的主要成份是连翘、金银花、大黄、甘草、板蓝根等。部分患者服用后出现烧心，考虑是药物成分在分解消化吸收过程中，刺激胃酸及胆汁分泌增多引起。这个症状一般不明显，停用药物后可以自行缓解，症状明显时，可以服用专业药物促进下排，减轻症状。另外对于外感寒邪入侵导致的风寒感冒，会很明显的加重感冒症状。建议在医师指导下口服连花清瘟胶囊。注意平时有胃胀、怕凉、不思饮食的，不要吃连花清瘟胶囊。
感冒出现低热、头痛等症状时，服用连花清瘟胶囊通常有较好的治疗效果。
感冒是由病毒或细菌等病原体引起的急性上呼吸道感染。当这些病原体进入机体后，会产生大量炎性物质，使体温中枢异常，出现低热症状。而当机体发热后，头部血管扩张，引发头痛问题。因此，建议患者及早用药来避免症状加重，连花清瘟胶囊具有广谱抗病毒作用，能抑制副流感病毒、呼吸道合胞病毒等多种病毒，发挥抗炎、退热等多种作用，对感冒引起的头痛、发热、鼻塞、流涕、咳嗽、咽干咽痛、乏力、肌肉酸痛多种症状均可有效缓解。并且该药安全性良好，服用后不易产生嗜睡等不良反应。
连花清瘟胶囊主要功效是清热解毒、清肺泻热，主要用于治疗风热感冒和流行性感冒。而风寒感冒是由于风寒之邪内袭，肺气失宣所致，治疗风寒感冒主要是驱寒宣肺，服用连花清瘟往往不会缓解病情，甚至还会加重。
