肺孢子菌肺炎治疗首选方法是药物治疗。比较常见的药物可以选择复方磺胺甲恶唑，要选择早发现早治疗的方式，让身体快速的恢复，通过早期的判断能够查看出病情的轻重程度是比较重要的。如果病情持续的发展导致越来越严重，通常是没有太好的特效药物改善。患者出现肺孢子菌肺炎，通常是肺孢子菌导致了间质性细胞炎症，这些情况是很少见的。
可以短期内适当的使用糖皮质激素，应该适当的卧床休息，维持正常的生命体征，保证稳定正常的水电解质、酸碱平衡。在出现缺氧状态时可以适当的吸氧，保证孩子呼吸道的畅通。
肺孢子菌肺炎的饮食和护理要注意多补充营养，多吃高热量、高蛋白、高维生素的食物。多喝水，不吃辛辣、生冷的食物，多吃橘子、香蕉、苹果、梨等新鲜的水果。护理方面，主要是为了避免交叉感染，需要密切观察，并在必要的时候使用药物。建议患者应该适当的卧床休息，维持正常的生命体征，保证稳定正常的水电解质、酸碱平衡。
大部分肺炎经过规范治疗可以治愈，但是患有糖尿病、血液病、艾滋病、肝病，或原有支气管肺疾病的，容易并发特殊病原体感染的肺炎，儿童患流感或麻疹时，也易患此病，出现坏死性肺炎，肺脓肿、肺气囊肿和脓胸，若治疗不及时或不当，病死率极高，大部分肺炎经过规范的治疗，是可以被治愈的。
间质性肺炎一般不能治愈。出现间质性肺炎之后，通常没有比较好的特效药物改善，可以在医生指导下通过细胞毒类或者激素类的药物做联合治疗。患者还需要结合自身的情况如果出现这种疾病之后，感觉浑身不舒服，要及时到正规医院做相关的治疗，以免危害到身体健康，出现这种疾病的原因，通常是因为吸入了大量的粉尘或者不明气体以及服用药物所引起的。
