肛门脓肿最主要的症状是疼痛，这种疼痛会非常剧烈，且逐渐加重，很多病人说会吃不下，睡不着。脓肿自行溃破后，疼痛暂时有所缓解。低位脓肿出现剧烈肛门疼痛，且这种疼痛持续不减。直肠周围脓肿（高位）就不一定会疼痛。因为直肠周围属于盆腔，这里分布的植物神经对普通刺激不敏感，最主要表现是局部坠胀和便意感。
肛门脓肿的症状。肛门脓肿属于肛周的一种急性感染，多继发于肛腺的炎症反复发作不愈，病人会有明显的肛门疼痛伴有发热，排便时也会导致症状的加重，深部的脓肿还会有明显的寒战和乏力，化验也会表现为血常规白细胞和中性粒细胞比例明显增高，查体在肛周表现为皮肤充血水肿的炎症表现，局部充进行穿刺可以获得脓液，早期诊断应该及时的选择手术切开引流。
肛瘘多是肛门脓肿的后遗症，大多均有肛门脓肿病史或有肛门脓肿手术史，有的肛门脓肿自溃症状消失后自己觉得好了就不去医院就诊了。肛周脓肿术后形成肛瘘常用症状有，切口久不愈合，肛门脓肿手术切口久不愈合，有脓牲分泌物从切口溢出，局部有压痛。
肛门脓肿表现为肛周不间断性疼痛，活动后加重，肛旁皮肤红肿，可触及硬结，成熟的肛门脓肿可以摸到波动感。建议行彩超检查，如果已形成，需要手术切开引流，没有成熟可先消炎，部分感染轻的可以治好，或者可以加快促进成熟。
肛瘘多是肛门脓肿的后遗症。肛周脓肿术后形成肛瘘常用症状有，1：切口久不愈合，肛门脓肿手术切口久不愈合，有脓牲分泌物从切口溢出，局部有压痛。2：切口愈合后不久局部又出现肿胀疼痛，一至二天左右自溃流黄水，且反复发作。
引起肛周脓肿的原因有：感染，是肛周脓肿的主要原因；直肠内异物损伤，病人因食用红枣误吞枣核，枣核横向位于直肠末端，尖头刺破肠壁，导致直肠黏膜损伤，从而引起肛周脓肿；疾病因素，如直肠癌感染也可发生肛周脓肿。
