双侧卵巢囊肿通常进行手术治疗比较好。
双侧卵巢囊肿患者比较年轻或者年龄在停经之前，可以采用卵巢囊肿切除术来保存卵巢组织。如果无月经异常或无怀孕的情况，只有一方卵巢囊肿较为显著，可采用患侧卵巢囊肿剥除术。
如果是高龄患者或者是绝经后的女性，并且卵巢囊肿太大，对患侧的卵巢造成了很大的压力，而彩超没有发现有正常的卵巢组织，就需要做输卵管卵巢切除术。
卵巢囊肿如果是生理性并且囊肿在5厘米以下不算严重，如果发现囊肿大于6厘米，并且有逐渐增大的现象，就建议及早住院进行手术治疗了。卵巢囊肿是不会有生命危险的。
卵巢囊肿可以药物或手术治疗。
卵巢囊肿的发生和不良生活饮食习惯以及内分泌失调，遗传因素等有关，检查出有卵巢囊肿先确定是生理性还是病理性的，生理性的卵巢囊肿不用治疗，病理性的小的卵巢囊肿可以服用药物活血化癥治疗，但大的囊肿可能会出现蒂扭转，建议手术治疗。
有卵巢囊肿一定要定期复查囊肿的生长速度，平时避免不良生活习惯，保证充足睡眠，不要吃刺激类的食物，不吃发物。
多囊卵巢和卵巢囊肿相比，多囊卵巢更为严重。是因为多囊卵巢属于内分泌疾病，常常是由于遗传因素和环境因素相互作用导致的，由于卵泡不能正常生长发育和排出，因此就会导致女性出现月经失调、面部痤疮，甚至肥胖等其他并发症，还可能影响女性的生育功能。卵巢囊肿可能是生理性囊肿，也可能是普通的卵巢囊肿，或者是子宫内膜异位症导致的卵巢巧克力囊肿这些疾病通过手术治疗以后往往都可以治愈，而且不容易影响女性正常受孕。
卵巢囊肿一般都不严重的，主要指的是生理性的囊肿。一般滤泡囊肿或者是黄体囊肿等，多数2-3个月都能消退的，卵巢上的囊肿一般来说都不严重。如果发现卵巢上的囊肿，一般建议首先定期复查，建议是2-3个月之后，月经干净的第1天去医院做个彩超，看卵巢囊肿的情况。要是持续性的存在囊肿，一般建议进行手术切除治疗。就怕有病变的可能，暂时先检查看看，观察看看，有一些人可以在观察期间口服桂枝茯苓胶囊等也有帮助。
