单纯的卵巢囊肿是不影响月经的，但是恶性的就不好说。如果卵巢只是长了囊肿，没影响到卵巢功能，卵巢分泌功能还是正常的，是不会影响月经的。一旦长了卵巢囊肿，首先得做彩超，看看囊肿大小，周围的边界回声，有没有血流信号。如果是恶性的，无论大小必须马上手术，恶性的会引起不规则出血、月经不调。如果是良性的，定期复查就可以。
卵巢囊肿分为卵巢生理性的囊肿和卵巢病理性的囊肿，生理性的囊肿也就是正常的月经中期出现的卵巢黄体囊肿。生理性囊肿顾名思义是正常的生理现象，不用做特殊的处理，随着月经的结束，卵巢生理性的囊肿都会自然地萎缩、吸收，不必做特殊的处理。病理性的囊肿病理类型是不一样的，包括卵巢浆液性囊肿和卵巢黏液性囊肿等。
卵巢囊肿会引起腹痛的，应该去医院彩超检查囊肿的变化，如果卵巢囊肿比较大了，还是手术治疗比较好的，卵巢囊肿手术恢复挺好的。术后一定要注意休息，不要吃生冷硬的食物，不要着凉。
巧克力卵巢囊肿一般指子宫内膜异位囊肿。通常情况下，子宫内膜异位囊肿目前为止病因还不清楚。子宫内膜异位囊肿是指卵巢内的异位子宫内膜组织周期性反复出血，形成被卵巢实质包裹的血肿，当具有活性的子宫内膜细胞种植在卵巢局部的时候，随着每次来月经异位症的病灶，在卵巢内也会出现出血的现象，患者可以通过囊肿剔除术、囊肿穿刺术、卵巢切除术等方式进行治疗。
目前还没有专门的理论来解释卵巢囊肿的原因，但一般和遗传因素以及个体因素有关。
1、遗传因素：女性或外祖母患有卵巢囊肿的后代更容易得卵巢囊肿；
2、个体因素：正常发育时出现的良性囊性肿瘤，比如卵巢畸胎瘤。所有的患者都有不同的原因。
女性在做卵巢囊肿的时候，可以主观的触摸到附件区囊性肿物或者是包块。通过B超、彩超等检查，可以明确腹前区是否有囊性肿块，具体的可以通过磁共振和CT检查来明确。
妊娠发现卵巢囊肿，它的治疗要视孕期迟早而定、包块的尺寸及属性，及病人是否有病症。
早孕期间囊肿嵌在盆腔内，可导致流产，中期妊娠易合并蒂扭转，晚期妊娠，如果肿瘤很大就会引起胎位异常，分娩时会导致肿瘤破裂，如果肿瘤位置偏低，会梗阻产道，造成难产。
早孕并发卵巢囊肿，如在怀孕早期，卵巢囊肿直径在6厘米以下，可多为妊娠所致生理性囊肿，这类通常可在不治疗的情况下自然消退。如果囊肿一直延续到孕中期，未见萎缩，但亦不会增加，亦可在产后再行治疗。如果卵巢囊肿呈扩大趋势，或对恶性可能有较高疑虑者立即手术治疗。若妊娠期卵巢囊肿蒂扭转，还需马上做手术。
