10天-15天可以治愈，冷冻治疗，适用于低位单纯性肛瘘的治疗，是利用液氮使瘘道发生凝固性坏死。继而脱落，形成新的创面而自愈。电疗仪治疗，运用现代肛瘘电疗仪的高温物理技术治疗，利用电弧放电产生高温，对局部组织进行烧灼，以切开肛瘘达到治疗目的。
治好肛瘘的基本标准就是肛门能正常排便，伤口基本愈合。在伤口愈合期需要注意保持大便通畅，尽量吃流质和软食。对于伤口严重愈合期时间会长一点，建议平日活动量减少，偶尔步行活动，增加肠蠕动即可。术后病人要注意随时监测体温，术后要保持肛门的清洁避免感染，遵医嘱给予一些肛门栓剂，或者每日药物清洗肛门。在术后第一次排便期，会感觉疼痛难耐，属正常现象，若是便秘可以用一些肛门润滑剂。
长期肛瘘不治会引起流脓流水，污染亵服，引起病菌滋生，可引发肛门湿疹、肛门瘙痒等其他肛肠疾病。肛瘘的多发性，可形成直肠阴道瘘、直肠尿道瘘和直肠膀肤瘘，危及四面脏器，并且肛瘘有恶变倾向。肛瘘一旦确诊后要及早手术治疗，一般的正规医院均可以做。
肛瘘的危害很大，一旦患有了肛瘘以后，都会特别的痛苦。而且一旦肛瘘形成，自愈的机会极少，瘘管复杂化后，带来许多麻烦与一定的危害性。当如果选择好的医院，先进的技术是可以治好不复发的。
肛瘘的治疗主要是进行手术，保守治疗不能好，可根据肛瘘具体情况选择挂线疗法、瘘管切开术、肛瘘切除术，从资料来看可能是瘘管切开术，具体情况可咨询手术医生，术后定期换药，去除脓性分泌物，如有必要可应用药物治疗，忌酒辛辣食物。
由于反复发作，脓液可穿透管壁，沿括约肌间隙扩散，形成多发复杂的肛瘘，不仅给治疗带来困难，而且影响肛门的正常生理功能。任由肛瘘发展，可对括约肌造成严重损伤，甚至可能造成肛门失禁等并发症。