正畸治疗的流程，一般是要到正规医院的口腔科，或者是大型医院的口腔正畸科进行检查。先由医生进行口腔内的全面检查，进行诊断。看是哪一种类型的颌骨畸形或者是牙齿畸形，进行曲面断层片和头颅侧位片的检查。
口腔正畸通俗地讲，就是将不整齐的牙齿排列整齐。牙齿不齐属于一大类疾病――错颌畸形，包括牙齿与颌骨、上下牙弓、上下颌骨、颌骨与颅面之间的不协调等许多疾病，与龋齿、牙周病一起被列为口腔三大常见病，发病率很高，可以达到50％以上。
牙列拥挤或者牙齿前突时为了排齐牙齿，可能需要减数拔牙，拔哪颗牙需要拍片子，取牙齿模型，经过分析测量来决定，拔牙以后，通过佩戴矫正器很快就会关闭拔牙间隙，对身体没有危害。
有牙周病是否能做正畸，要根据具体情况来判断。
如果患者的牙周病很轻，只是有一点点的牙槽骨的吸收，那么经过一系列的牙周疗法，会改善牙床的状况，不会再被吸收，并且在一定的程度上可以进行正畸的处理。另外，由于得了严重的疾病，不能停止的情况下，会松动，但是对于一个中度到严重的牙周病来说，即便没有最终的处理，也会出现三度以上的松动，这会导致牙周病的恶化。此时不可以正畸。
检查需要拍X光片，拍摄面部牙合照片、取模型，用于医生对牙齿畸形进行分析、诊断和设计，以及留待日后与治疗结束时作对比。制定矫正计划，初戴矫治器，开始第一次在口腔粘固矫治器，即初戴牙套。