两者的区别在于，药物的成分不同，另外治疗适应症上有所不同，前者有安神功效，药性较强，阴虚体质的人会上虚火，而后者有利湿，以补脾气为主，药性平和，治疗脾虚湿盛证。
一般情况下，健脾与醒脾是两种不同的概念，具体内容如下：
健脾是指脾虚，使脾助消化的功能下降。可以口服补益脾气的药物，主要是通过调理脾胃来弥补脾气的不足，从而将食物转换成自己的能量。
醒脾是治疗脾气被湿气所困，脾气虚，无法发挥脾的功能，从而限制脾的功能。这时候可以用一些芳香化湿健脾的药物，唤醒被困的脾气，让脾的运行能力得到恢复。
一般情况下，启脾丸具有健脾和胃的作用。具体分析如下：
启脾丸主要由人参、炒白术、茯苓、甘草、陈皮、山药、莲子等多种药材制作而成，能够起到健脾和胃的作用，通常用于治疗脾胃虚弱、消化不良、腹胀便溏等病症。建议患者在医生指导下使用此药物，不可以私自使用，以免产生不良反应。注意服药期间不要吃生冷、油腻、辛辣等食物，以免影响药效。
一般情况下，反流性食管炎患者可以吃健脾丸，具体内容如下：
如果患者患有反流性食管炎，可能会出现反酸、烧心、胃胀、纳差、嗳气等症状。而健脾丸有助于调理患者的脾胃功能，有利于改善胃痛胃胀、身软乏力等症状。因此，反流性食管炎患者是可以吃健脾丸的，这有助于缓解患者的不适症状。此外，患者应注意调整饮食结构，要避免食用辛辣刺激性食物，以免加重胃肠道的负担。
建议服用归脾丸眼袋，就是下眼睑浮肿，由于眼睑皮肤很薄，皮下组织薄而松弛，很容易发生水肿现象，从而产生眼袋。脾胃主运化水谷，脾胃功能直接影响到人体肌肉功能和体内脂肪的代谢。如果脾胃功能失调或者是减弱了，那么就会水湿运化不畅，皮肤和肌肉就会缺乏营养，变得没有弹性。久而久之就会出现眼睑下垂，最后导致了眼袋的形成。归脾丸可以治疗脾虚。归脾丸之所以会叫这个名字。主要就是因为它治疗脾的功能很不错，它可以有效的益气健脾、凝血固本，并且对于血虚的人群也可以起到调理的效果。特别是日常经常会出现头晕无力，疲乏困倦的人群，吃归脾丸的治疗效果很不错。用法用量：用温开水或生姜汤送服。一次9克（约一瓶盖），一日3次注意事项：对本品过敏者禁用。忌生冷食物；忌思虑过度及过劳，保持良好的心态，少熬夜。
如果单纯是脾虚湿气重的话，可以考虑选择健脾丸。可以通过健脾的方式来去吃。归脾丸除了健脾之外，还比较侧重于补气血，所以如果你有存在气血不足，身体困乏无力怕冷之类的，那么也可以选择归脾丸，而单纯只是脾虚导致湿气大，就可以选择健脾丸，效果会更好一些。平时也需要注意饮食结构，别吃一些油腻的食物，这些都有可能会加重湿气，至于药物效果，还要看个人体质吸收。