龟头炎多采用药物治疗，包括口服和外用抗菌药，如果病人合并包皮过长或包茎可以切除包皮。此外，病人应养成良好的卫生习惯，及时清洗包皮。如果是因为不洁性行为造成的龟头炎，应杜绝。
霉菌性龟头炎在临床上主要表现，可能会发红，表面有一些分泌物，阴茎头、冠状沟和包皮内板红肿，并有散在的红色丘疹；病人痒感特别明显，有时候甚至奇痒，阴茎头和阴茎皮肤奇痒、灼热是本病最突出的症状；夫妻，女方，或者性伴侣方可能会有阴道豆腐渣样分泌物，有一种难闻的气味。
霉菌性龟头炎是包皮龟头炎的一种类型，是由于感染了霉菌导致的，一般常见的是白色念珠菌感染。临床症状上和普通的包皮龟头炎症状也差不多，早期可能会出现龟头包皮红肿、瘙痒，然后慢慢的出现包皮龟头部位长小红点，脱皮，脱屑；后期因为内裤摩擦还有可能出现这些小红点溃疡糜烂出血等现象。
霉菌性龟头炎要及时治疗，每日流水清洗外阴，然后涂抹特比萘芬软膏，坚持用药两周。饮食要注意清淡，避免辛辣刺激，治疗期间禁止性生活。如果同时有脚癣的情况，要一起治疗，避免复发。
手术治疗大约需要1个月，非手术治疗半个月左右到20天左右，主要的原因是包皮过长和包茎，诱因主要是最近病人可能生活工作压力大，过度的劳累、进食刺激性食物和饮酒、吸烟过多导致的免疫力低下，也可以通过性接触而诱发。