主要的治疗方法有每日清水清洗包皮、龟头，彻底清除包皮腔内的包皮垢，保持局部的清洁卫生。外涂药膏，性伴侣或配偶同时治疗。如果包皮龟头炎反复发作，也可以做包皮环切手术。
真菌性包皮龟头炎需要抗真菌治疗。每天可以用一些消炎水进行治疗。有必要在专业人士的指导下使用药物。暂时不要做爱，以免传染给对方。注意个人卫生，经常换内衣，不要吃辛辣食物。
预防霉菌性包皮龟头炎复发的措施有：第一、解除引起霉菌性包皮龟头的环境，环境因素比较重要，大部分包皮过长、包茎有问题的男性，常常会引发霉菌性包皮龟头炎，所以，要解决包皮过长或包茎有问题的情况。第二、积极治疗身体其他部位的真菌感染，如手足癣、股癣等。第三、治疗期间避免进行性生活，女方积极进行检查、治疗，避免性生活交叉感染。
包皮龟头炎可能出现的症状：包皮红肿、龟头红肿，炎症可致包皮和龟头出现水肿的改变，外观上可见局部皮肤发红，并且明显肿胀。龟头和包皮的疼痛，可出现明显的疼痛。龟头、包皮表面可见糜烂或者分泌物增多的现象，在急性期可见炎性渗出改变，随着炎症进一步发展，可形成小的糜烂病灶，表面可有渗血、渗出等。龟头红斑或龟头溃疡形成，可见境界清楚的红斑，红斑上可见小疱疹或者小丘疹样的改变。
男性得了霉菌性龟头炎后，留取龟头的分泌物做涂片检查或者培养检查，如涂片发现真菌或者霉菌，则建议抗真菌治疗。常用药物有酮康唑或氟康唑片，口服，每日1-2次。其次还可以进行局部清洗，保持龟头分泌物清洁，并且保持龟头干燥。
