最有效的治疗龟头炎方法是用洗液浸洗，并敷以消炎软膏治疗，服用抗过敏药物及外用的软膏，如因包茎或包皮水肿不能翻转浸洗，引流不畅，经一般治疗炎症仍不能消退，可行包皮背切开术以利引流等炎症，完全消退后再行包皮环切术。
龟头炎是一类疾病的总称，引起龟头炎的病因相当多，大致可以分为感染、过敏、外伤、药物、肿瘤等诸多因素。而各类因素又可以细分成许多因素，如感染，可以分为细菌、真菌、病毒、支原体、衣原体、滴虫等微生物感染。
龟头炎多采用药物治疗，包括口服和外用抗菌药，如果病人合并包皮过长或包茎可以切除包皮。此外，病人应养成良好的卫生习惯，及时清洗包皮。如果是因为不洁性行为造成的龟头炎，应杜绝。
龟头应该先去确诊是为什么疼，在具体治疗。不可以乱用药。如果是过敏导致龟头发炎，则需弄清过敏原是什么。有些人可能对消炎药、避孕套等过敏，这时就需远离过敏原并同时使用抗过敏药物。此外，还应适当使用抗菌素，以防继发感染。
龟头炎需要使用抗真菌的药物进行治疗。龟头炎一般是霉菌性包皮龟头炎，主要是由于包皮过长，包皮腔内有尿液残留造成，可以使用抗真菌的药物治疗，通过抑制或杀灭真菌，在一定程度上能治疗龟头炎症，但最根本的治疗方式应该是做包皮环切手术，术后经常龟头外露，就不容易有霉菌生长。建议患者到泌尿科进行检查，在医生的指导下进行治疗，日常注意休息，多喝水，保持局部卫生，尤其是性生活前后卫生。
