少数肛周脓肿药物，热水坐浴及局部理疗等可以消散，但多数需要手术治疗。平时应该注意不吃辛辣刺激，注意局部卫生，饮食以清淡易消化为主，禁食辛辣刺。激性油腻食物，适当补充营养。
肛门直肠周围脓肿的治疗原则主要是控制感染扩散，减轻病人的痛苦，少数病情较轻的肛周脓肿用抗生素、热水坐浴及局部理疗等，脓肿可以消散，需要手术治疗，保守疗法包括全身或局部应用有效的抗生素，静脉滴注或灌肠外用，一旦脓肿形成，最积极的方法是及时切开引流。
肛周脓肿化脓以后就会触及到波动感，需要进行手术及时的切开排脓，对于表浅的肛周脓肿，可以选择口服药物治疗，如果是范围比较大的脓肿，需要手术方式还要具体的病情来决定。
避免挤压。保持肛周清洁卫生。多喝水，多吃蔬菜水果，忌辛辣等刺激性食物。治疗得当，保养得好，一般两周左右即可恢复正常。如两周后仍无恢复或病情加重，应到正规医院肛肠科检查就诊。
要及时的去医院接受正规的手术治疗，不要自己乱买药物给小孩服用，要听从医生的嘱咐去治疗。注意营养合理，食物尽量做到多样化，多吃高蛋白、多维生素、低动物脂肪、易消化的食物及新鲜水果、蔬菜，不吃陈旧变质或刺激性的东西，主食粗细粮搭配，以保证营养平衡。
中医治疗肛周脓肿具有其独特的优势，但仅限于对早期肛周脓肿的治疗。中医以消法治疗为主，常用的方剂有仙方活命饮、五味消毒饮，同时配合清热解毒、止痛止痒的中药口服及金黄解毒膏外用，大多数患者可达到临床治好。
