复发性口腔溃疡又称为复发性阿弗他溃疡，复发性口疮。复发性口腔溃疡病因比较复杂，存在明显的个体差异性，发病因素众多，目前还没有明确的病因学说。引起因素包括自身免疫异常，体液免疫异常，细胞免疫异常。
总是口腔溃疡是因为，局部刺激因素。口腔内有残冠、残根、不良修复体、不良正畸，长期反复摩擦口腔黏膜，造成口腔溃疡，这种情况需要及时到医院就诊，祛除口腔内的局部刺激因素，溃疡就可以痊愈。如果长期刺激口腔黏膜，很容易导致口腔黏膜病损的癌变。营养因素。人体缺乏维生素、微量元素，也容易导致口腔溃疡的反复发生。
小孩口腔溃疡可能是非感染因素导致的，如免疫力低下、缺乏维生素等，特别是b族维生素、缺锌等，再有就是生活习惯不好，如长期进食辛辣刺激性食物，不注意口腔卫生等。如果是感染性因素导致的，比如细菌和病毒感染均可导致口腔溃疡，需要使用抗生素治疗，病毒感染后的疱疹性口腔炎后期会形成溃疡，抗病毒治疗有效。孩子的口腔溃疡往往是感染性因素和非感染性因素一起作用的结果。
经常性口腔溃疡的原因是缺乏维生素或微量元素缺乏、营养不良、吃油腻油炸、辛辣刺激性食物导致上火出现口腔溃疡或者是长期服用西药时间长，容易产生副作用和抗药性；不重视口腔溃疡，没有注意饮食和口腔卫生问题，导致口腔溃疡反复发作和没有注意休息时间，导致内分泌失调紊乱；口腔溃疡可以使用西瓜霜喷剂喷涂溃疡部位，可以减少疼痛和加快溃疡愈合。
口腔溃疡是全身疾病在口腔的一种表现，比如白塞病，表现为口腔溃疡，眼干和生殖器的溃疡。或者是身体缺乏维生素或者是铁元素，都容易引起溃疡发作。口腔溃疡也可能和自身的免疫力低下有关系，口腔溃疡有一定的自愈能力，两周左右能够自愈，超过两周不能愈合的，需要进行活组织检查。